193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5269 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  95.38 
 
 
133 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  54.03 
 
 
148 aa  144  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  29.03 
 
 
160 aa  62  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32.8 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  29.03 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  34.65 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  29.03 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  29.03 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  29.03 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  29.03 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  29.03 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  29.03 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  32.28 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  29.03 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  29.03 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  34.35 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  33.6 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  32.81 
 
 
127 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  36.36 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  34.48 
 
 
185 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  33.61 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  32.28 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
168 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  28.99 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  31.2 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  28.99 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  28.99 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  29.75 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  34.17 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
162 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  32.28 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  29 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  30.43 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.14 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  30.43 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  29 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  31.01 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1824  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
138 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.177937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  29.71 
 
 
161 aa  52  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  32.5 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  31.01 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  30.51 
 
 
140 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  28.03 
 
 
144 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  29.71 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  29.71 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  29.71 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  29.71 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  29.71 
 
 
155 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  29.25 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  29.52 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  32.28 
 
 
167 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  31.71 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  34.29 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.15 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>