122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1824 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1824  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 138 aa  270  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.177937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7775  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.327682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.9 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  30.47 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  38.6 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  28.91 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  38.6 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  25.83 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  32.8 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  37.08 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  39.53 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 136 aa  48.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  36.67 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  36.67 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  37.93 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  34.88 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  30.36 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  33.71 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  35.07 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  31.37 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  33.79 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 		 167 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  31.76 
 
 		 319 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  24.32 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  36.96 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  33.7 
 
 		 329 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  35.11 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  30.58 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  35.79 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  31.97 
 
 		 152 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  32.93 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4149  hypothetical protein  37.63 
 
 		 276 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  31.2 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  35.06 
 
 		 334 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 151 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  31.2 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  31.2 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  31.97 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 		 180 aa  42  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  27.35 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  31.2 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  30.16 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  31.2 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  31.5 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  22.81 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  31.2 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  31.2 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  31.2 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 140 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30 
 
 		 127 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  27 
 
 		 158 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  31.03 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  32.23 
 
 		 156 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  29.35 
 
 		 149 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.03 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.65 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  31.03 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  32.77 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  32.28 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  27.97 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  32.53 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  32.28 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  32.28 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  32.28 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>