184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3519 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 169 aa  340  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  80 
 
 		 149 aa  244  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  80 
 
 		 149 aa  244  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  74.47 
 
 		 145 aa  215  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  65.73 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  68.53 
 
 		 151 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  65.73 
 
 		 151 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  65.73 
 
 		 151 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  54.68 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  48.32 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  42.57 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  41.78 
 
 		 148 aa  120  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  48.09 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  46.27 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  37.75 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  40.29 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  39.23 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  36.55 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  39.86 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  48.11 
 
 		 153 aa  104  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  40.88 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  43.9 
 
 		 132 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  38.24 
 
 		 136 aa  94.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  34.56 
 
 		 147 aa  87.8  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  36.67 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  38.33 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  44.68 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  33.58 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  40.66 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  35.65 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  38.32 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  30.3 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32.2 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  32.84 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  32.43 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  29.55 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  32.45 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  32.45 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  33.04 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  31.48 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  32.45 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31.36 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  32.2 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.2 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  31.36 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  31.36 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  29.29 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  29.29 
 
 		 238 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  29.29 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  29.29 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  29.29 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  29.29 
 
 		 248 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.51 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  29.29 
 
 		 374 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  31.36 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  33.78 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 		 133 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  30.51 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  30.51 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  28.81 
 
 		 154 aa  51.2  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  30.51 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  30.51 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  30.51 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  30.51 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  30.51 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2571  hypothetical protein  50.94 
 
 		 99 aa  50.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163005  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>