207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5992 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  62.86 
 
 
185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  60 
 
 
151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  62.86 
 
 
151 aa  180  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  62.14 
 
 
151 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  59.03 
 
 
154 aa  174  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  53.62 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  53.62 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  52.14 
 
 
145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  54.68 
 
 
169 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  46.26 
 
 
155 aa  147  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  45.27 
 
 
148 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  52.31 
 
 
159 aa  140  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  43.36 
 
 
146 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  46.15 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  46.43 
 
 
153 aa  130  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  43.42 
 
 
162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  47.18 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  47.86 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  41.01 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  45.93 
 
 
136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  45.9 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  43.26 
 
 
146 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  43.07 
 
 
142 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  47.83 
 
 
155 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 
138 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  44.17 
 
 
129 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  42.03 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  40.58 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  37.19 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  35.46 
 
 
163 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  38.06 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  36.19 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  41.12 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  37.38 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  37.23 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  33.58 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  32.33 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  32.33 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  32.33 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  32.28 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  31.58 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.25 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  32.76 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  34.51 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  38.82 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  35.58 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  32.61 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  35.96 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  37.29 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
181 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  28.46 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  43.24 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  37.08 
 
 
199 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  37.08 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  33.62 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  37.08 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  30.83 
 
 
147 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  30.83 
 
 
177 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  30.83 
 
 
238 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 
160 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  30.83 
 
 
177 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  30.83 
 
 
177 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  35.79 
 
 
209 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  35.79 
 
 
374 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  35.96 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  29.41 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0664  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0461861  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  35.96 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  41.33 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.46 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.57 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.9 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>