77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2042 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  100 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  47.89 
 
 		 163 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  38.94 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  38.98 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  38.94 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  37.12 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  34.43 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  34.4 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  34.4 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  34.4 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  34.26 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  35.09 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  34.95 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  32.79 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  34.95 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  35.34 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.99 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  32.79 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  31.93 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  33.91 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  32.97 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  30.08 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  29.51 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  32.67 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  29.51 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  36.94 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  28.69 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  28.69 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  37.21 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 213 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  31.79 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  31.73 
 
 		 209 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  29.9 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 		 165 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 168 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 144 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  26.73 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  28.89 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  28.89 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  28.91 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  28.89 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  31.03 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3502  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.61093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  27.14 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  28.24 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 137 aa  40.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>