224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1073 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  300  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  99.3 
 
 
142 aa  288  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  46.81 
 
 
151 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  47.83 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  48.09 
 
 
159 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  44.12 
 
 
150 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  43.26 
 
 
152 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  46.43 
 
 
138 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  44.44 
 
 
145 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  41.91 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  41.91 
 
 
185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  45.65 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 
162 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  43.85 
 
 
153 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 
154 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 
169 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 
155 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  43.07 
 
 
147 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  39.57 
 
 
146 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  40.71 
 
 
153 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  41.79 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  38.3 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  41.8 
 
 
124 aa  90.5  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  41.18 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  33.1 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  33.1 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  33.1 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  33.1 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
152 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  33.1 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  33.09 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
213 aa  72  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  33.1 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  35.88 
 
 
158 aa  72  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  31.94 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  31.94 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  31.94 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  31.94 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  32.39 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  32.39 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  32.39 
 
 
374 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  33.87 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  33.83 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.58 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  33.01 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  33.64 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  33.58 
 
 
148 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  41.43 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  35.9 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  34.82 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  34.95 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  31.68 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 
161 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  31.68 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  31.68 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  34.68 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  29 
 
 
131 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
139 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  34.21 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  34.4 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  37.63 
 
 
165 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  36.27 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  31 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  33.64 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  32.1 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  37.86 
 
 
158 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  35.96 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  30.69 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  30.69 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>