More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5089 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
165 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  57.42 
 
 
209 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  52.2 
 
 
191 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  42.33 
 
 
232 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  44.67 
 
 
183 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  45.51 
 
 
191 aa  128  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  40.12 
 
 
176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  40.24 
 
 
225 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  40.52 
 
 
176 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  40.52 
 
 
176 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  40.54 
 
 
174 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  38.65 
 
 
181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  38.31 
 
 
170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  41.26 
 
 
182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  40.82 
 
 
187 aa  107  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  42.36 
 
 
169 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  39.19 
 
 
185 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  40.28 
 
 
169 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 
158 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  41.98 
 
 
159 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  40.56 
 
 
179 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  40.85 
 
 
179 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  41.09 
 
 
156 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  40.3 
 
 
189 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  36.31 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
146 aa  95.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 
139 aa  94.4  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  39.47 
 
 
193 aa  94.4  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  39.31 
 
 
204 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  35.86 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  37.06 
 
 
161 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  35.86 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  37.01 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  37.4 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  35.04 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  37.01 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  40.31 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  38.76 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  44.33 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 
151 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  34.06 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  34.48 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  35.88 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  36.43 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  34.59 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30.89 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  35.94 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  34.17 
 
 
160 aa  72  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  32.31 
 
 
159 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  33.87 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.86 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  32.79 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  35.25 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  35.25 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  32.28 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  40.66 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  32.5 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  32.5 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  37 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.25 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  33.33 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  40.66 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  45.35 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  38.1 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  31.67 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  36.67 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  38.38 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  36.67 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>