216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3546 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  88.2 
 
 		 182 aa  326  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  65.34 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  62.43 
 
 		 193 aa  234  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  64.94 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  64.16 
 
 		 204 aa  228  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  53.93 
 
 		 187 aa  205  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  70.15 
 
 		 139 aa  198  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  53.23 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  44.75 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  44.51 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  45.14 
 
 		 179 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  50.68 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  52.41 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  45.07 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  46.53 
 
 		 169 aa  141  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  44.74 
 
 		 158 aa  141  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  43.71 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  47.95 
 
 		 160 aa  138  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  48.57 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  48.59 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  41.26 
 
 		 147 aa  131  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  47.89 
 
 		 158 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  45.32 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 		 146 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  43.92 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  44.2 
 
 		 176 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  44.2 
 
 		 176 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 		 144 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  43.17 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  40.54 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 		 144 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 144 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 144 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  39.13 
 
 		 145 aa  115  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  41.18 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  41.18 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  41.91 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 145 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  41.18 
 
 		 145 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  40.71 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 145 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  39.19 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  41.91 
 
 		 145 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  44 
 
 		 174 aa  104  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 		 179 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  35.98 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  35.46 
 
 		 146 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  42.65 
 
 		 145 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  35.76 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  42.65 
 
 		 145 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  42.65 
 
 		 145 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  42.65 
 
 		 145 aa  95.5  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  42.65 
 
 		 145 aa  95.5  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  42.96 
 
 		 145 aa  94.7  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  41.91 
 
 		 145 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  39.46 
 
 		 164 aa  85.9  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  40.4 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.86 
 
 		 148 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.15 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.82 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  33.08 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32.82 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  27.82 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  33.62 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  31.3 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.82 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  41.11 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.62 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  38.95 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 		 152 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 		 161 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  29.01 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  31.48 
 
 		 143 aa  51.6  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0327  hypothetical protein  30.69 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000150784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>