129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0327 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0327  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  322  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000150784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2825  thioesterase superfamily protein  42.18 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249346  normal  0.0935289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0110  phenylacetic acid degradation-related protein  41.43 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 184 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  36.73 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  31.13 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  28.46 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  29.2 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  26.32 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.43 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  28.46 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  30.69 
 
 		 185 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  24.37 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  24.37 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  25.21 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  24.37 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  24.37 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  24.37 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  24.37 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  24.37 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  30.23 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  33.66 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 232 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  24.8 
 
 		 191 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  25.2 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  30.23 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  27.93 
 
 		 146 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  26.47 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  29.41 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  24.29 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  24.29 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  27.08 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  32.22 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  28 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  30.21 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  35.71 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  30.21 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  24.29 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  31.11 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  32.99 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  32.93 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  31.46 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  29.91 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  24.5 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  24.22 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  31.11 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  33.73 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  24.79 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  27.08 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.14 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29.03 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  27.08 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  26.53 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  30.21 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  33.7 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  30.21 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  23.08 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  29.79 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  29.55 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  33.75 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  21.43 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  30.21 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  30.21 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  30.21 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  30.21 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  30.21 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  27.17 
 
 		 138 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>