More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3189 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  97.76 
 
 		 134 aa  266  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  97.76 
 
 		 153 aa  266  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  97.76 
 
 		 134 aa  266  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  97.76 
 
 		 134 aa  266  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  95.52 
 
 		 153 aa  262  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  88.81 
 
 		 134 aa  248  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  88.81 
 
 		 134 aa  248  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  88.81 
 
 		 134 aa  248  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  88.81 
 
 		 134 aa  248  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  87.31 
 
 		 134 aa  245  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  88.89 
 
 		 126 aa  234  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  88.89 
 
 		 126 aa  234  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  88.89 
 
 		 126 aa  234  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  79.1 
 
 		 134 aa  224  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  74.44 
 
 		 134 aa  213  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  74.44 
 
 		 134 aa  213  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  59.57 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  65.32 
 
 		 138 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  41.35 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  40.87 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  43.17 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  43.17 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  39.57 
 
 		 153 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  36.84 
 
 		 134 aa  91.3  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  32.82 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  32.82 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  38.38 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  34.48 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  34.48 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  28.45 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  37.04 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  28.81 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  31.82 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  35.35 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  32.31 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  29.85 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  35.58 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  34.95 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  28 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  35.92 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  32.71 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  36 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  29 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  30.17 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  36.03 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  31.43 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.37 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  31.48 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  30.48 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  32.59 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  30.48 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  53.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  31.07 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  30.48 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  30.48 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  36.36 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  30.56 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  35.23 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  31 
 
 		 374 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  29.85 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  29.63 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  30.48 
 
 		 248 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  28.21 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  35.71 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  27.73 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  29.52 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  29.52 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  29.52 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>