81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3817 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  275  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  95.04 
 
 
141 aa  244  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  95.04 
 
 
141 aa  244  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  63.57 
 
 
140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  64.29 
 
 
140 aa  170  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  58.57 
 
 
140 aa  160  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  55.22 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  55.38 
 
 
156 aa  137  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  52.9 
 
 
145 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 
147 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  51.45 
 
 
141 aa  126  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  51.8 
 
 
169 aa  126  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  49.26 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  47.79 
 
 
142 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  48.87 
 
 
138 aa  123  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 
142 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  49.29 
 
 
142 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  48.53 
 
 
143 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  47.79 
 
 
142 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  53.96 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  53.85 
 
 
148 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  53.08 
 
 
148 aa  116  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  47.29 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  46.32 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  56.39 
 
 
145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  56.82 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  46.32 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  43.94 
 
 
137 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  45.11 
 
 
140 aa  107  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  51.82 
 
 
142 aa  106  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  43.08 
 
 
138 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  43.08 
 
 
138 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  44.27 
 
 
137 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  40.71 
 
 
147 aa  100  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  39.26 
 
 
135 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  40 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
147 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  45.54 
 
 
137 aa  84  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  35.71 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 
153 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  34.52 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  34.52 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  34.52 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  34.52 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  36.46 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  32.14 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  32.14 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  32.14 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  32.14 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  32.14 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  32.14 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  32.14 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  32.94 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  32.14 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  30.48 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  36.47 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  30.15 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  29.86 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  29.81 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  31.37 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
127 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
136 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.94 
 
 
124 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  30.43 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  28.97 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28 
 
 
126 aa  40  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>