81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4386 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
153 aa  309  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  77.85 
 
 
154 aa  240  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  76.71 
 
 
154 aa  235  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  62.42 
 
 
146 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  40.82 
 
 
138 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  39.22 
 
 
141 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  42.25 
 
 
134 aa  104  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  41.55 
 
 
134 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  40.85 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  40.85 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  40.85 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  40.85 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  42.34 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  42.34 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  42.34 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  40.14 
 
 
134 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  41.01 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  41.01 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  39.44 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  41.01 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 
139 aa  94.4  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  39.57 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  39.57 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  40.58 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 
154 aa  87  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  36.88 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  41.51 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  38.1 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  39.81 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  37 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  37 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  36 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  37 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  35.92 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  33.96 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  35.92 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  33 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  30.39 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  29.7 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  30 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  31.3 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  35 
 
 
135 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  30.77 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  35.24 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  35.87 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  33.66 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  31.52 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  31.52 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  31.07 
 
 
141 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  32.69 
 
 
137 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  29.89 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  30.43 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  27.45 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  30.83 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  29.21 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  32.05 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.86 
 
 
153 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
160 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  26.92 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  22.79 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  32.35 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>