84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2695 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  100 
 
 		 143 aa  289  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  87.14 
 
 		 142 aa  248  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  86.52 
 
 		 142 aa  244  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  84.4 
 
 		 142 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  84.4 
 
 		 142 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  83.33 
 
 		 142 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  57.66 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  59.42 
 
 		 169 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  56.3 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  49.26 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  50.38 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  50.38 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5730  thioesterase superfamily protein  51.82 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  49.26 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  48.53 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  48.85 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  46.72 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  48.09 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  47.41 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2490  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2713  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  47.33 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  45.26 
 
 		 135 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  52.59 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2418  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  46.92 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  51.85 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  50.41 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  50.41 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  50.36 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  46.38 
 
 		 147 aa  110  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  51.16 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  41.48 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  40.74 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  46.56 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  48.09 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  49.61 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  40.44 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  45.05 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  40.95 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  40.95 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  39.45 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  38.68 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  38.68 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  36.79 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  39.25 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  38 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  37 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  37 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  38 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  37 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  37 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  37 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  37 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  38 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  37 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  37 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  38 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  38 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  36 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  39.24 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  39.24 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  37.36 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  38.96 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  24.44 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.43 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  28.85 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  28.24 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  32.69 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  31.94 
 
 		 140 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>