251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2088 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 182 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  45.59 
 
 		 204 aa  116  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  45.99 
 
 		 193 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  42.22 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  44.88 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  41.84 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  42.34 
 
 		 182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  41.35 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  40.88 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  44.85 
 
 		 189 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  48.67 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  49.54 
 
 		 179 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  47.71 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  40.29 
 
 		 184 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 		 146 aa  97.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  40.6 
 
 		 176 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  41.35 
 
 		 170 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  42.37 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  40 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  40 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  40 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  38.41 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  39.55 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  39.29 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  37.14 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  37.14 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 183 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  36.03 
 
 		 209 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  37.86 
 
 		 165 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  37.86 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  39.69 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  30.66 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  37.14 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  32.61 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  32.39 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.82 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  33.82 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  42.24 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  38.26 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  39.39 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  36.99 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  42.24 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  36.21 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  30.88 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 		 161 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  38.68 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  36.67 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  35.9 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  37.61 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  37.61 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  37.89 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  33.62 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  32.76 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  32.76 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  32.76 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  32.97 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  33.61 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0284  thioesterase superfamily protein  35.63 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.719156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  31.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  31.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  31.86 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>