169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0829 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  52.59 
 
 
138 aa  140  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  45.52 
 
 
149 aa  121  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  41.79 
 
 
136 aa  106  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 
146 aa  103  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  31.63 
 
 
129 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  28 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  28 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  34.91 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
176 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  23.73 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  28 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  28 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  28 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  28 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  28 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32.23 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  29.59 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  28 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  28 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
148 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
184 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 
158 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  27.41 
 
 
187 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 
193 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  34.19 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
189 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  33.33 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  26.97 
 
 
174 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
183 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  26.5 
 
 
134 aa  50.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  27.59 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  27.19 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  33.02 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
204 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  22.41 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  22.22 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  28.81 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  28.81 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  52.08 
 
 
158 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 
232 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  31.58 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  29.25 
 
 
139 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  30.19 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  29.06 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  29.89 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  28.21 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  26.83 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
225 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  31.78 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  27.12 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  27.52 
 
 
169 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  27.45 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  26.27 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
169 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  26.5 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  27.55 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  24.35 
 
 
191 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  28.3 
 
 
185 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  25.21 
 
 
176 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  25.21 
 
 
176 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2844  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.56 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  25.26 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.81 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  26.77 
 
 
146 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3386  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.220189 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>