88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5460 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  100 
 
 
146 aa  293  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  75.34 
 
 
154 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  73.29 
 
 
154 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  62.42 
 
 
153 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  45.32 
 
 
138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  45.59 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  44.85 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  43.88 
 
 
141 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  44.12 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  44.12 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  44.12 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  44.12 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  45.04 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  45.04 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  45.04 
 
 
126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  43.94 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  43.17 
 
 
134 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  43.18 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  42.86 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 
153 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  41.35 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  41.35 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  46.1 
 
 
139 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 
154 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  35.82 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  34.31 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  34 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  34.31 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  34.65 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  33.94 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  32.09 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  29.41 
 
 
135 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  32.71 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  32.71 
 
 
138 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  31.78 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  29.03 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  29.91 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  28.23 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  30.3 
 
 
140 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
169 aa  48.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
160 aa  48.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.81 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  31.76 
 
 
141 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.98 
 
 
135 aa  47  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  30.59 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.98 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  30.59 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  28.05 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  25.34 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  29.1 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  32.74 
 
 
158 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  36.78 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  28.36 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  29.75 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  30.49 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  28.23 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  30.49 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 
147 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  30.21 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  27.47 
 
 
151 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
153 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  26.24 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2128  hypothetical protein  27.97 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  28.09 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>