More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1689 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 154 aa  317  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  91.67 
 
 		 146 aa  270  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  63.08 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  59.86 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  60.77 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  58.46 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  54.55 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  47.01 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  46.48 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0328  thioesterase superfamily protein  46.03 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  39.34 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  39.34 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  31.16 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  39.34 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  32.26 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  33.66 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  33.94 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  33.94 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  33.94 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  31.45 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  31.45 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  34.95 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  33.03 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  37.36 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  29.84 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  27.42 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  37.36 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  36.26 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  36.26 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  32.11 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  30.43 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  28.23 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  39.24 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  31.52 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  29.57 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  31.19 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  31.19 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  31.19 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  31.19 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  31.19 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  28.72 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  31.19 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  31.19 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  34.02 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  29.09 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  32 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  28.18 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  31.63 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  31.63 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  31.63 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  27.27 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  29.91 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  26.32 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.16 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  30.97 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  27.27 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  25 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  31.19 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  37.08 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  29.57 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  29.01 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.58 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  27.91 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>