216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0149 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  98.51 
 
 
134 aa  268  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  99.21 
 
 
126 aa  253  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  99.21 
 
 
126 aa  253  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  99.21 
 
 
126 aa  253  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  91.04 
 
 
134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  91.04 
 
 
134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  91.04 
 
 
134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  91.04 
 
 
153 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  91.04 
 
 
153 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  88.81 
 
 
134 aa  248  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  88.81 
 
 
134 aa  248  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  82.09 
 
 
134 aa  232  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  77.44 
 
 
134 aa  221  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  77.44 
 
 
134 aa  221  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  65.32 
 
 
141 aa  173  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  66.13 
 
 
138 aa  173  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  48.15 
 
 
154 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  43.17 
 
 
154 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 
139 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 
154 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  34.59 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  32.09 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.86 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.86 
 
 
135 aa  67  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29.85 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  34.26 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  29.66 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  31.2 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  36.11 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  28.93 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  35.19 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  36 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
191 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  36.11 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  25.86 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  37 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  28.93 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  31.82 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  32.41 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  30.08 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1283  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  32.95 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  28 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  34.09 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2153  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
132 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446608  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  27.03 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 
209 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10950  hypothetical protein  29.63 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0792  hypothetical protein  34.26 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.37 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0788  hypothetical protein  34.26 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.456543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1005  hypothetical protein  28.7 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  29.1 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  26.44 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  30.17 
 
 
147 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  27.73 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  30.68 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  21.67 
 
 
149 aa  50.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  29.91 
 
 
154 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0327  hypothetical protein  24.37 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000150784  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  27.1 
 
 
169 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0905  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  31.48 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0264  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0140955  normal  0.333225 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  27.55 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  32.38 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2244  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  32.14 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  32.38 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  30.93 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30.43 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>