60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1023 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1023  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 154 aa  300  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.42478  normal  0.0264332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1959  thioesterase superfamily protein  52.11 
 
 		 139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  43.38 
 
 		 134 aa  120  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  40.56 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  42.65 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5460  putative thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303228 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  42.65 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  42.65 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  42.65 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3552  phenylacetic acid degradation-like protein  40.82 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  42.96 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  42.96 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  42.96 
 
 		 126 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0301  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.107347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  40.14 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  41.55 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  38.51 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  39.16 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  39.16 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  39.16 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  39.16 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  37.06 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  40.12 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1721  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.462617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  36.08 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  42.24 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3105  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2706  phenylacetic acid degradation-like protein  26.39 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593217  normal  0.495042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2936  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119328 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2670  phenylacetic acid degradation-like protein  28.57 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  29.37 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2695  phenylacetic acid degradation-like protein  32.04 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0513713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2456  phenylacetic acid degradation-related protein  29.37 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51890  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00655808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4613  thioesterase superfamily protein  37.76 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0131034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  32.63 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4593  putative thioesterase family protein  31.07 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1259  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000497987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3153  phenylacetic acid degradation-related protein  30.99 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.625413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  22.12 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0147  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3817  hypothetical protein  36.47 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  31.68 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3834  hypothetical protein  35.29 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3529  hypothetical protein  35.29 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3960  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  32.1 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  30.86 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  32.73 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  31.52 
 
 		 168 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  29.9 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>