More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1607 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
162 aa  333  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  86.16 
 
 
159 aa  291  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  85.44 
 
 
159 aa  286  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  85.35 
 
 
160 aa  286  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  85.44 
 
 
159 aa  285  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  85.44 
 
 
159 aa  285  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  85.44 
 
 
159 aa  285  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  85.99 
 
 
159 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  85.99 
 
 
159 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  85.99 
 
 
159 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  85.99 
 
 
159 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  85.35 
 
 
159 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  83.65 
 
 
161 aa  280  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  82.17 
 
 
166 aa  276  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2046  thioesterase superfamily protein  87.97 
 
 
158 aa  274  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  decreased coverage  0.00531586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1502  thioesterase superfamily protein  83.65 
 
 
162 aa  268  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0333721  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  74.68 
 
 
161 aa  258  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  74.68 
 
 
161 aa  257  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0298  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  79.11 
 
 
162 aa  250  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.22  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  72.08 
 
 
158 aa  240  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  70.13 
 
 
158 aa  228  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  59.33 
 
 
158 aa  203  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  54.72 
 
 
163 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05222  thioesterase  79.61 
 
 
159 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  55 
 
 
168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  58.87 
 
 
168 aa  177  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  51.02 
 
 
315 aa  168  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  54.97 
 
 
170 aa  168  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  47.77 
 
 
328 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  47.77 
 
 
327 aa  165  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  57.94 
 
 
149 aa  160  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  62.5 
 
 
168 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  48.61 
 
 
147 aa  154  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  59.12 
 
 
170 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 
170 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  58.39 
 
 
170 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 
170 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  58.39 
 
 
170 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  55.63 
 
 
170 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  52.71 
 
 
149 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  61.74 
 
 
187 aa  151  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  61.61 
 
 
168 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  61.61 
 
 
168 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  61.61 
 
 
168 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  61.61 
 
 
168 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  61.61 
 
 
168 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  61.61 
 
 
168 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  61.61 
 
 
168 aa  150  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  45.27 
 
 
319 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 
168 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  37.97 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  37.97 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  37.97 
 
 
164 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  38.31 
 
 
161 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  38.96 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 
161 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  37.42 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  37.16 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 
187 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  45.3 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
162 aa  110  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21700  acyl-CoA hydrolase  38.19 
 
 
324 aa  110  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  34.9 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  41.46 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  37.01 
 
 
187 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  40.13 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  38.51 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  40.83 
 
 
178 aa  108  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  36.55 
 
 
163 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 
169 aa  107  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  36.48 
 
 
166 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 
161 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  32.92 
 
 
188 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  33.55 
 
 
160 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  36.48 
 
 
166 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  41.86 
 
 
173 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  44.54 
 
 
146 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  40.5 
 
 
178 aa  104  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.58 
 
 
161 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 
161 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
162 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  43.2 
 
 
179 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
176 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  39.31 
 
 
185 aa  100  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
161 aa  100  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 
180 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  35.17 
 
 
180 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  34.46 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
182 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  41.13 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  39.09 
 
 
161 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  39.09 
 
 
161 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  39.09 
 
 
161 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  35.57 
 
 
189 aa  92  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>