More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0502 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
315 aa  642    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  56.72 
 
 
319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  55.92 
 
 
328 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  55.48 
 
 
327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  57.04 
 
 
159 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  54.23 
 
 
161 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  52.38 
 
 
159 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  52.38 
 
 
159 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  52.38 
 
 
159 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  52.38 
 
 
160 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  52.38 
 
 
159 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  53.9 
 
 
159 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  53.9 
 
 
159 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  53.9 
 
 
159 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  51.02 
 
 
162 aa  168  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  53.9 
 
 
159 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 
159 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  51.75 
 
 
158 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  51.02 
 
 
161 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  51.75 
 
 
161 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  48.61 
 
 
158 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  48.3 
 
 
166 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0298  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  53.85 
 
 
162 aa  156  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.22  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  51.02 
 
 
149 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  51.75 
 
 
158 aa  155  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 
149 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  46.36 
 
 
163 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1502  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 
162 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0333721  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21700  acyl-CoA hydrolase  32.36 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2046  thioesterase superfamily protein  49.66 
 
 
158 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  decreased coverage  0.00531586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  49.28 
 
 
168 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  49.28 
 
 
170 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  48.55 
 
 
168 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  51.94 
 
 
147 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  50 
 
 
187 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  50 
 
 
168 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  50 
 
 
168 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  50 
 
 
168 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  50 
 
 
168 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  50 
 
 
168 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  50 
 
 
168 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  50 
 
 
168 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 
170 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 
170 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 
170 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 
170 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 
170 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  51.69 
 
 
170 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  49.28 
 
 
168 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05222  thioesterase  57.14 
 
 
159 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
327 aa  99.4  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  33.12 
 
 
171 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  35.62 
 
 
168 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  32.45 
 
 
164 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  32.92 
 
 
168 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 
176 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  35.62 
 
 
182 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  31.79 
 
 
167 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  31.79 
 
 
167 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  33.1 
 
 
169 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  31.79 
 
 
161 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  32.7 
 
 
166 aa  92.4  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  32.7 
 
 
166 aa  92.4  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 
162 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
180 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  34.44 
 
 
166 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
161 aa  89.7  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  34.44 
 
 
166 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
160 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  34.27 
 
 
188 aa  89.4  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
168 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  35.86 
 
 
162 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
163 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
161 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  36.24 
 
 
187 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  32.59 
 
 
161 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  30.77 
 
 
180 aa  86.3  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  36.3 
 
 
158 aa  85.9  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
161 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.08 
 
 
161 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  37.01 
 
 
146 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  38.76 
 
 
185 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  30.46 
 
 
188 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 
172 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
178 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0003  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
311 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0806344 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  37.01 
 
 
173 aa  84  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  36.28 
 
 
153 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 
171 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  34.97 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  29.8 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  33.55 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  34.17 
 
 
157 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 
145 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
167 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 
179 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  31.91 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>