More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4109 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 328 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  92.21 
 
 		 327 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  55.92 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  51.41 
 
 		 319 aa  318  7.999999999999999e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  50.96 
 
 		 159 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  50.34 
 
 		 159 aa  169  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  49.07 
 
 		 161 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 		 159 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 		 159 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 		 159 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  47.17 
 
 		 159 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  47.77 
 
 		 162 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  47.17 
 
 		 159 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  47.17 
 
 		 159 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  47.17 
 
 		 159 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  47.17 
 
 		 159 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21700  acyl-CoA hydrolase  34.95 
 
 		 324 aa  165  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  46.25 
 
 		 160 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  47.02 
 
 		 161 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  49.65 
 
 		 158 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  46.75 
 
 		 158 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 		 158 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  45.39 
 
 		 161 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 		 149 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  46.94 
 
 		 166 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1502  thioesterase superfamily protein  48.98 
 
 		 162 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0333721  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2046  thioesterase superfamily protein  49.66 
 
 		 158 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  decreased coverage  0.00531586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  51.85 
 
 		 168 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  51.03 
 
 		 147 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 		 149 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 		 170 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0298  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  50 
 
 		 162 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.22  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  51.11 
 
 		 168 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  44.97 
 
 		 163 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  54.48 
 
 		 187 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  53.73 
 
 		 168 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  53.73 
 
 		 168 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  53.73 
 
 		 168 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  53.73 
 
 		 168 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  53.73 
 
 		 168 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  53.73 
 
 		 168 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  53.73 
 
 		 168 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 		 168 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 170 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 170 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 170 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 170 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 170 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 170 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05222  thioesterase  40.14 
 
 		 159 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  25.43 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 		 161 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 		 168 aa  97.8  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 166 aa  92.4  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 166 aa  92.4  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 161 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  34.64 
 
 		 180 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 160 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 168 aa  89.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 162 aa  89.4  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  32.21 
 
 		 163 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  32.21 
 
 		 164 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  31.69 
 
 		 178 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 168 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 167 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 167 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 161 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 161 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 		 167 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  26.16 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  30.82 
 
 		 182 aa  85.9  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 		 161 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  31.51 
 
 		 166 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.43 
 
 		 161 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 161 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  26.78 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  31.51 
 
 		 166 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  34.09 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  29.58 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  24.35 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 		 167 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 187 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 		 171 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 179 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  34.71 
 
 		 153 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  30.71 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 176 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2084  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305359  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  37.4 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  32.82 
 
 		 146 aa  80.9  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  32.82 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  33.33 
 
 		 157 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  33.83 
 
 		 170 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>