More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72810 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  98.75 
 
 
160 aa  330  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  85.62 
 
 
161 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  84.38 
 
 
161 aa  270  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  79.75 
 
 
166 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  83.12 
 
 
160 aa  268  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  79.11 
 
 
166 aa  266  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  80.5 
 
 
161 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  80 
 
 
161 aa  257  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  77.07 
 
 
163 aa  257  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  75.8 
 
 
167 aa  255  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  75.8 
 
 
167 aa  255  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  74.52 
 
 
164 aa  251  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  73.12 
 
 
161 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  80.62 
 
 
161 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  80.62 
 
 
161 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  73.03 
 
 
161 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  68.9 
 
 
169 aa  240  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  77.99 
 
 
161 aa  239  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  71.05 
 
 
167 aa  234  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  73.47 
 
 
162 aa  229  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  69.8 
 
 
168 aa  222  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  67.97 
 
 
168 aa  221  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 
166 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 
166 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  65.81 
 
 
168 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  66.22 
 
 
171 aa  218  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  66 
 
 
178 aa  216  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  71.71 
 
 
162 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  63.33 
 
 
187 aa  206  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  62 
 
 
188 aa  203  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  66.23 
 
 
180 aa  202  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  69.66 
 
 
180 aa  197  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  61.69 
 
 
167 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  67.15 
 
 
178 aa  192  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  56.69 
 
 
162 aa  191  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  62.91 
 
 
153 aa  184  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  63.12 
 
 
161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  53.55 
 
 
173 aa  181  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  56.64 
 
 
185 aa  178  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  56.62 
 
 
146 aa  176  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  55.94 
 
 
187 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 
179 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  59.7 
 
 
176 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  46.31 
 
 
180 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  47.95 
 
 
182 aa  148  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  47.52 
 
 
187 aa  147  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  44.23 
 
 
185 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  49.62 
 
 
176 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  44.3 
 
 
167 aa  121  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  41.83 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  41.83 
 
 
158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  40.29 
 
 
155 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  43.61 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  45.9 
 
 
168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  42.07 
 
 
170 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  44.78 
 
 
175 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  45.9 
 
 
168 aa  111  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
166 aa  111  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  37.28 
 
 
172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  34.16 
 
 
161 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  43.88 
 
 
168 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.28 
 
 
159 aa  107  1e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  32.92 
 
 
162 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  38.04 
 
 
169 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  36.99 
 
 
149 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  32.92 
 
 
161 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  44.2 
 
 
170 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  44.2 
 
 
170 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  44.2 
 
 
170 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  44.2 
 
 
170 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 
170 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  39.52 
 
 
187 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  33.8 
 
 
147 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 
170 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.21 
 
 
159 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.23 
 
 
160 aa  101  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  33.54 
 
 
161 aa  101  7e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  43.48 
 
 
168 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  43.48 
 
 
168 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  43.48 
 
 
168 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  43.48 
 
 
168 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 
158 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 
149 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  43.48 
 
 
168 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  43.48 
 
 
168 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  43.48 
 
 
168 aa  100  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.55 
 
 
159 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  33.55 
 
 
159 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  33.55 
 
 
159 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  33.55 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
158 aa  98.2  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  34.67 
 
 
159 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>