More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4528 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 161 aa  336  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  78.62 
 
 		 160 aa  261  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  77.99 
 
 		 188 aa  260  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  82.39 
 
 		 161 aa  258  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  81.13 
 
 		 161 aa  254  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  73.29 
 
 		 163 aa  251  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  80.77 
 
 		 160 aa  247  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  78.62 
 
 		 161 aa  245  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  78.62 
 
 		 161 aa  244  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  72.96 
 
 		 166 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  69.87 
 
 		 164 aa  237  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  72.33 
 
 		 166 aa  237  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  70.25 
 
 		 161 aa  235  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  69.23 
 
 		 167 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  69.23 
 
 		 167 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  67.52 
 
 		 162 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  70 
 
 		 161 aa  231  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  78.62 
 
 		 161 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  78.62 
 
 		 161 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  71.05 
 
 		 169 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  68.39 
 
 		 168 aa  228  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  66.88 
 
 		 168 aa  222  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 167 aa  222  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  67.11 
 
 		 171 aa  216  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  65.99 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  65.99 
 
 		 166 aa  214  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  63.87 
 
 		 168 aa  214  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  70.27 
 
 		 162 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  62.99 
 
 		 167 aa  204  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  66.22 
 
 		 178 aa  204  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  64.19 
 
 		 187 aa  201  5e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  64.86 
 
 		 188 aa  199  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  65.73 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  66.21 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  66.91 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  66.21 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  62.76 
 
 		 153 aa  187  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  55.7 
 
 		 185 aa  178  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  56.38 
 
 		 162 aa  177  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  66.42 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  64.93 
 
 		 176 aa  174  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  51.02 
 
 		 173 aa  164  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  52.35 
 
 		 187 aa  163  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  52.48 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  46.71 
 
 		 189 aa  157  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  46.41 
 
 		 185 aa  149  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  43.59 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  51.06 
 
 		 169 aa  147  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  45.58 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  43.51 
 
 		 187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  41.45 
 
 		 172 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  43.79 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  49.6 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  40.27 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.16 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  38.82 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  34.19 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  41.04 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  38.16 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  38.16 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  39.19 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  39.19 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  39.19 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  39.19 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  39.61 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  35.06 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  40.4 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  40.3 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  37.16 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  40.25 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  34.03 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  38.51 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  44.27 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.78 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  44.8 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.54 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.73 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  35.1 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  35.71 
 
 		 158 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  32.45 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0298  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  36.13 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.22  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1502  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0333721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  40.77 
 
 		 248 aa  100  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  43.2 
 
 		 173 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  38.76 
 
 		 163 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2046  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  decreased coverage  0.00531586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  43.81 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  43.81 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  43.81 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0936  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 		 172 aa  97.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 		 165 aa  97.4  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>