More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1557 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 188 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  75.42 
 
 		 187 aa  291  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  75.28 
 
 		 178 aa  290  8e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  69.39 
 
 		 166 aa  224  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  69.39 
 
 		 166 aa  224  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  68.06 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  63.52 
 
 		 164 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 168 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  67.35 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  67.35 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  65.77 
 
 		 169 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  62.42 
 
 		 161 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  65.99 
 
 		 168 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  63.27 
 
 		 168 aa  205  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  65.07 
 
 		 163 aa  204  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  64.19 
 
 		 162 aa  203  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  62 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  62 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  65.31 
 
 		 161 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  62.5 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  62.5 
 
 		 166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  63.45 
 
 		 162 aa  195  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  68.38 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  67.91 
 
 		 161 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  68.66 
 
 		 160 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  73.95 
 
 		 161 aa  194  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  67.16 
 
 		 161 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  67.91 
 
 		 161 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  64.83 
 
 		 167 aa  191  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  70.54 
 
 		 180 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  63.33 
 
 		 161 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  60.54 
 
 		 167 aa  186  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  67.72 
 
 		 161 aa  184  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  73.68 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  73.68 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  63.5 
 
 		 146 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  63.04 
 
 		 173 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  65.83 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  65.73 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  71.55 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  67.42 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  68.46 
 
 		 176 aa  171  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  56.2 
 
 		 187 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  52.38 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  54.23 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  50.67 
 
 		 189 aa  154  6e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  51.35 
 
 		 180 aa  151  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  50.37 
 
 		 169 aa  149  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  49.65 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  49.25 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  45.8 
 
 		 158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 248 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  40.94 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  39.16 
 
 		 161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  38.51 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  46.03 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 		 167 aa  108  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 		 161 aa  108  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  36.42 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  36.42 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  36.42 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.98 
 
 		 159 aa  104  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.13 
 
 		 159 aa  104  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 		 166 aa  104  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 		 159 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 		 159 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 		 159 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 		 159 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  42.52 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.35 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  40.68 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  49.07 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  49.07 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  44.54 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  44.54 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  44.54 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  44.54 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  44.54 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  44.54 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  44.54 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  44.54 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  38.62 
 
 		 170 aa  99.4  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0276  thioesterase superfamily protein  41.79 
 
 		 176 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 158 aa  98.6  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>