More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2906 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 319 aa  649    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  56.72 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  51.41 
 
 		 328 aa  308  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  51.45 
 
 		 327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 		 158 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  50.36 
 
 		 161 aa  155  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 161 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  49.32 
 
 		 159 aa  152  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  48.92 
 
 		 161 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 		 159 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  49.64 
 
 		 160 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 		 159 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 		 159 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 		 159 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21700  acyl-CoA hydrolase  33.23 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  47.3 
 
 		 159 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  47.3 
 
 		 159 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  47.3 
 
 		 159 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  47.3 
 
 		 159 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  47.3 
 
 		 159 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  45.27 
 
 		 162 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  45.95 
 
 		 166 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 158 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2046  thioesterase superfamily protein  47.3 
 
 		 158 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  decreased coverage  0.00531586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1502  thioesterase superfamily protein  45.95 
 
 		 162 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0333721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  47.48 
 
 		 158 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0298  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  48.92 
 
 		 162 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.22  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  48.15 
 
 		 168 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  46.53 
 
 		 168 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 		 170 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  48.12 
 
 		 149 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 		 149 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0794  thioesterase superfamily protein  53.1 
 
 		 168 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216547  normal  0.0788297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  44.12 
 
 		 163 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 147 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  48.57 
 
 		 187 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  47.86 
 
 		 168 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2941  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  47.86 
 
 		 168 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000325804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  47.86 
 
 		 168 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0258  thioesterase family protein  47.86 
 
 		 168 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  47.86 
 
 		 168 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2516  thioesterase family protein  47.86 
 
 		 168 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  47.86 
 
 		 168 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  50.88 
 
 		 170 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  50.88 
 
 		 170 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  50.88 
 
 		 170 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  50.88 
 
 		 170 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  50.88 
 
 		 170 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  50.88 
 
 		 170 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05222  thioesterase  52.04 
 
 		 159 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  34.18 
 
 		 168 aa  97.4  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  32.45 
 
 		 168 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 166 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 166 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 161 aa  89.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 167 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 		 178 aa  86.3  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 		 168 aa  85.9  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  24.48 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2084  thioesterase superfamily protein  25.34 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305359  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  32.86 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  31.25 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  33.57 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  31.94 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  31.94 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  31.94 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  32.64 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  34.09 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  32.86 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 162 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  32.64 
 
 		 169 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.59 
 
 		 161 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 161 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  30 
 
 		 180 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 133 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  32.05 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  36.44 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 		 145 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  35.66 
 
 		 158 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  32.47 
 
 		 161 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0003  thioesterase superfamily protein  23.44 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0806344 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  28.82 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  36.45 
 
 		 146 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  30.92 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3071  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  30.06 
 
 		 171 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  34.35 
 
 		 157 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 164 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>