More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2084 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2084  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 311 aa  642    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305359  normal  0.763617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0104  thioesterase superfamily protein  51.44 
 
 		 318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  35.99 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0172  thioesterase superfamily protein  31.72 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2000  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1869  thioesterase superfamily protein  29.87 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1253  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0003  thioesterase superfamily protein  27.08 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0806344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2906  thioesterase superfamily protein  27.52 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4109  thioesterase superfamily protein  25.89 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3882  thioesterase superfamily protein  23.67 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000227508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  31.08 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  31.3 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 167 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 167 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 162 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  30.92 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0502  thioesterase superfamily protein  22.49 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  28.77 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  30.26 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  34.11 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  30.41 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 		 176 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 		 145 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 		 171 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 		 164 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  28.78 
 
 		 159 aa  68.2  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  30.71 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 158 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 161 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  28.29 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 		 178 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  28.76 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  31.33 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.58 
 
 		 161 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 160 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  29.1 
 
 		 163 aa  65.1  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 167 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0276  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 		 176 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0936  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.09 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  26.98 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3071  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1190  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  27.89 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  34.45 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  28.38 
 
 		 178 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0878  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 172 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 159 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 166 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  31.62 
 
 		 188 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1278  acyl-CoA hydrolase  40.19 
 
 		 136 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  31.85 
 
 		 146 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 161 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.56 
 
 		 160 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 169 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  31.06 
 
 		 173 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  27.07 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  27.07 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  26.39 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>