More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6613 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 171 aa  358  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  61.99 
 
 		 174 aa  202  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  60.61 
 
 		 173 aa  202  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  57.83 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  56.55 
 
 		 172 aa  181  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  50.3 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  49.33 
 
 		 169 aa  167  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  47.27 
 
 		 175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  47.31 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  42.25 
 
 		 164 aa  124  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  41.78 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1965  thioesterase superfamily protein  49.23 
 
 		 198 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1140  thioesterase superfamily protein  44.7 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  38.16 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1200  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1269  thioesterase superfamily protein  43.65 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.67 
 
 		 176 aa  104  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  35.33 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.03 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  37.66 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2687  thioesterase superfamily protein  47.89 
 
 		 167 aa  97.4  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.793889  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  34.25 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  39.29 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  39.29 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 163 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 161 aa  95.9  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  35.71 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.36 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  36.36 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.36 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 145 aa  95.1  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.42 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.42 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  34.42 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  34.42 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.42 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.42 
 
 		 168 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 170 aa  94.4  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  36.36 
 
 		 170 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.36 
 
 		 170 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  37.96 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  39.01 
 
 		 157 aa  94.4  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.42 
 
 		 168 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.42 
 
 		 168 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 		 168 aa  94  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  35.06 
 
 		 168 aa  94  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  35.06 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  35.06 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.71 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  35.51 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  37.23 
 
 		 163 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  34.42 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 178 aa  91.3  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 		 162 aa  90.9  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 134 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  40.52 
 
 		 139 aa  90.9  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.12 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  37.33 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 151 aa  90.5  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 139 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  39.66 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  30.34 
 
 		 180 aa  88.2  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  36.57 
 
 		 132 aa  88.2  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 139 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3496  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 		 146 aa  87.8  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  33.57 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  38.26 
 
 		 130 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  38.26 
 
 		 130 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  38.26 
 
 		 130 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  38.26 
 
 		 130 aa  87  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  38.26 
 
 		 132 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 		 132 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  38.26 
 
 		 132 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  38.26 
 
 		 132 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  38.26 
 
 		 132 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  33.81 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  38.26 
 
 		 132 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  38.26 
 
 		 132 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  38.26 
 
 		 132 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  38.39 
 
 		 130 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  32.89 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  32.37 
 
 		 161 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  31.17 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  37.39 
 
 		 132 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 		 139 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  33.81 
 
 		 168 aa  85.1  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.13 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  39.13 
 
 		 135 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>