More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1416 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  100 
 
 
176 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  74.71 
 
 
176 aa  271  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  74.71 
 
 
176 aa  271  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  50.31 
 
 
170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  49.69 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  49.69 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  49.69 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  49.69 
 
 
170 aa  162  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  49.69 
 
 
170 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  49.07 
 
 
170 aa  160  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  49.07 
 
 
170 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  49.07 
 
 
170 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  48.45 
 
 
170 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  48.45 
 
 
170 aa  158  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.67 
 
 
171 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  43.67 
 
 
171 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  43.67 
 
 
171 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.67 
 
 
168 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.67 
 
 
168 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.67 
 
 
168 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  49.68 
 
 
178 aa  141  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.04 
 
 
168 aa  140  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.04 
 
 
168 aa  140  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.67 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  43.23 
 
 
168 aa  138  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  43.04 
 
 
168 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  49.63 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 
175 aa  114  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  39.16 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  35.22 
 
 
161 aa  104  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  38.67 
 
 
171 aa  104  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  36.81 
 
 
169 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
167 aa  104  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  39.1 
 
 
157 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  39.72 
 
 
172 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  37.75 
 
 
165 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  36.73 
 
 
158 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.99 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  36.11 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
171 aa  98.6  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 
168 aa  98.6  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 
173 aa  98.2  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  38.84 
 
 
163 aa  97.8  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  41.44 
 
 
129 aa  96.3  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  39.52 
 
 
141 aa  95.5  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
147 aa  95.9  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  43.48 
 
 
120 aa  95.5  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  35.57 
 
 
163 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  34.64 
 
 
159 aa  95.9  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  43.48 
 
 
120 aa  95.5  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 
174 aa  95.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
141 aa  95.1  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  38.02 
 
 
163 aa  95.1  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
175 aa  95.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  32.64 
 
 
155 aa  94.4  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  37.69 
 
 
176 aa  94.4  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
135 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 
161 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
135 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
135 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
141 aa  94  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
135 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  38.39 
 
 
141 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  38.39 
 
 
141 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  36.99 
 
 
327 aa  92.8  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 
142 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  38.03 
 
 
169 aa  92.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
154 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.02 
 
 
143 aa  92  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  38.66 
 
 
143 aa  91.7  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
154 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
154 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
143 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
143 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
143 aa  92  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
154 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  38.81 
 
 
164 aa  91.3  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 
168 aa  91.3  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 
167 aa  90.9  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  37.78 
 
 
167 aa  90.9  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
143 aa  90.9  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 
171 aa  90.1  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  38.74 
 
 
127 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
149 aa  89.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
142 aa  89  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
248 aa  88.6  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
145 aa  89  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
161 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.92 
 
 
161 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 
171 aa  87.8  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>