More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1262 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
174 aa  359  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  69.05 
 
 
172 aa  224  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  61.99 
 
 
171 aa  224  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  67.88 
 
 
171 aa  222  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  62.35 
 
 
173 aa  207  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  59.04 
 
 
169 aa  203  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  56.36 
 
 
175 aa  200  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  57.14 
 
 
170 aa  191  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  47.95 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1965  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 
198 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  45.52 
 
 
164 aa  120  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2687  thioesterase superfamily protein  49.66 
 
 
167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.793889  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.38 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  40.41 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  40.4 
 
 
168 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  37.58 
 
 
168 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 
161 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
175 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.58 
 
 
168 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.58 
 
 
168 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 
176 aa  104  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  35.62 
 
 
180 aa  104  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.58 
 
 
168 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.58 
 
 
168 aa  104  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.58 
 
 
168 aa  104  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.58 
 
 
171 aa  104  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  37.58 
 
 
171 aa  104  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  37.58 
 
 
171 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  37.25 
 
 
169 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  36.94 
 
 
168 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  35.76 
 
 
158 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 
159 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  37.5 
 
 
157 aa  101  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  33.11 
 
 
161 aa  100  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  40.15 
 
 
164 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  36.24 
 
 
161 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.31 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
167 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
167 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  35.1 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
185 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  38.57 
 
 
166 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  38.57 
 
 
166 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
165 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 
151 aa  98.2  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  35.62 
 
 
164 aa  97.8  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  41.27 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  34.84 
 
 
155 aa  97.4  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  39.84 
 
 
136 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.81 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  35.98 
 
 
170 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 
145 aa  97.1  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  40.83 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  35.62 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
327 aa  96.3  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  40.83 
 
 
163 aa  95.5  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  38.06 
 
 
161 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
167 aa  95.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  35.98 
 
 
170 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  35.53 
 
 
188 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  35.53 
 
 
160 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  34.93 
 
 
187 aa  94.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  35.98 
 
 
170 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 
187 aa  94.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  36.84 
 
 
176 aa  94.4  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  36.84 
 
 
176 aa  94.4  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 
133 aa  93.6  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.98 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.81 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.98 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  35.98 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  35.98 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.98 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.98 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  35.86 
 
 
163 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 
129 aa  93.6  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 
170 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  38.06 
 
 
161 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  39.17 
 
 
163 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 
189 aa  92.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  34.06 
 
 
187 aa  91.7  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 
166 aa  92  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  35.37 
 
 
185 aa  92  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 
166 aa  92  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  37.78 
 
 
146 aa  91.7  5e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  34.38 
 
 
140 aa  91.3  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  39.84 
 
 
153 aa  91.3  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  36.69 
 
 
173 aa  91.3  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  36.36 
 
 
139 aa  90.9  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  36.09 
 
 
169 aa  90.9  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>