More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2309 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
175 aa  354  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  88.72 
 
 
173 aa  240  7e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  71.43 
 
 
167 aa  235  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  69.89 
 
 
176 aa  224  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  58.44 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  59.86 
 
 
158 aa  168  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  57.41 
 
 
170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  47.77 
 
 
169 aa  144  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  44.97 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  38.79 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  49.63 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  44.16 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  43.75 
 
 
188 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  47.33 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  43.56 
 
 
187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  47.33 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 
163 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  43.24 
 
 
162 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 
167 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  40.79 
 
 
162 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  47.73 
 
 
161 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  43.62 
 
 
185 aa  121  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  47.14 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
161 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  43.05 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  41.25 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  42.47 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  40.26 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  41.72 
 
 
189 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  36.97 
 
 
185 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.96 
 
 
159 aa  117  6e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.88 
 
 
170 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  39.88 
 
 
170 aa  117  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.88 
 
 
170 aa  117  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.88 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  39.88 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  40.65 
 
 
187 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.88 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  46.43 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  47.2 
 
 
153 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  49.19 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  39.88 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  39.26 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  39.88 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  44.3 
 
 
180 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  45.04 
 
 
161 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  39.88 
 
 
170 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  38.65 
 
 
170 aa  114  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  41.26 
 
 
161 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  37.58 
 
 
171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  42.55 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.73 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.73 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  39.73 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  39.73 
 
 
171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.73 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.73 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  39.73 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.73 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.73 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 
188 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  43.51 
 
 
161 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  38.36 
 
 
168 aa  111  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.26 
 
 
168 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  44.8 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  38.46 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  38.36 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  41.98 
 
 
160 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  39.73 
 
 
166 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  39.73 
 
 
166 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  43.45 
 
 
171 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1140  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 
161 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1200  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 
159 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  35.53 
 
 
187 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1269  thioesterase superfamily protein  48 
 
 
159 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  40.71 
 
 
157 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  46.38 
 
 
248 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 
174 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  43.59 
 
 
162 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  32.1 
 
 
176 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 
159 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 
169 aa  101  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
172 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  44.04 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  44.04 
 
 
147 aa  99.8  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  44.04 
 
 
161 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  39.74 
 
 
160 aa  98.6  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2687  thioesterase superfamily protein  45.27 
 
 
167 aa  98.2  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.793889  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  32.92 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  32.92 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>