More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1229 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
175 aa  359  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  70.3 
 
 
169 aa  239  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  65.27 
 
 
170 aa  220  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  56.36 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  55.42 
 
 
171 aa  173  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  55.29 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  47.27 
 
 
171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  50 
 
 
173 aa  155  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  43.28 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 
169 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.14 
 
 
176 aa  114  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.47 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  42.76 
 
 
167 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.14 
 
 
168 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
188 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.14 
 
 
168 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  35.92 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  35.92 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1965  thioesterase superfamily protein  47.76 
 
 
198 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.44 
 
 
168 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.44 
 
 
171 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  39.44 
 
 
171 aa  99  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  39.44 
 
 
171 aa  99  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
161 aa  99  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.44 
 
 
168 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 
168 aa  99.4  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.44 
 
 
168 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  38.24 
 
 
164 aa  98.2  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  34.46 
 
 
178 aa  98.2  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  37.5 
 
 
169 aa  98.2  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  40.56 
 
 
170 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
165 aa  98.2  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  38.19 
 
 
166 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
167 aa  97.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
167 aa  97.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.73 
 
 
168 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  38.73 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  45.54 
 
 
131 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  38.19 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  39.86 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  39.86 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 
135 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 
135 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 
135 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  40.8 
 
 
135 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 
127 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  40.83 
 
 
176 aa  95.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  33.1 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  36.81 
 
 
159 aa  94.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
170 aa  94.4  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
168 aa  94.4  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  39.84 
 
 
163 aa  94  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.65 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 
163 aa  92.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  33.8 
 
 
158 aa  92  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.6 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  40.6 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  40.6 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  36.02 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.6 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.6 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  35.07 
 
 
157 aa  91.3  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  38.21 
 
 
163 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  34.72 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  37.59 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  32.72 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  39.1 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  34.03 
 
 
161 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.76 
 
 
161 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 
178 aa  89  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  34.72 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  34.72 
 
 
160 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
187 aa  89  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  36.03 
 
 
161 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  40.16 
 
 
143 aa  88.2  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  35.33 
 
 
173 aa  87.8  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 
166 aa  87.8  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 
166 aa  87.8  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  36.03 
 
 
161 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  38.21 
 
 
133 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 
160 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  41.23 
 
 
120 aa  87  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  35.81 
 
 
185 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  41.23 
 
 
120 aa  87  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  34.45 
 
 
139 aa  86.3  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
134 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  35.53 
 
 
167 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
139 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 
160 aa  86.3  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  37.78 
 
 
146 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 
141 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
131 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
129 aa  85.9  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
157 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>