More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1772 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
139 aa  278  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  55.37 
 
 
131 aa  141  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 
132 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 
154 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
154 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
154 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
143 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
143 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
154 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
143 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  54.31 
 
 
129 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  53.45 
 
 
143 aa  134  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  54.1 
 
 
133 aa  134  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  48 
 
 
149 aa  134  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  55.65 
 
 
120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  55.65 
 
 
120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 
141 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  51.69 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 
135 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 
135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  52.54 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  49.15 
 
 
145 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  52.54 
 
 
141 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  51.28 
 
 
135 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  50.86 
 
 
141 aa  131  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  51.72 
 
 
136 aa  130  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
141 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 
136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  51.69 
 
 
143 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  46.61 
 
 
142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 
141 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 
137 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  47.93 
 
 
132 aa  122  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  48.31 
 
 
127 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  48.7 
 
 
131 aa  120  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  45.77 
 
 
176 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  47.76 
 
 
263 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
131 aa  117  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  51.28 
 
 
265 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 
143 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 
260 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  41.46 
 
 
165 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 
169 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  44.88 
 
 
168 aa  97.4  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 
119 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
159 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  45.69 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  41.46 
 
 
130 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  42.28 
 
 
170 aa  93.6  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.53 
 
 
171 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  39.53 
 
 
171 aa  91.3  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  39.53 
 
 
171 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.53 
 
 
168 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.53 
 
 
168 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.53 
 
 
168 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 
129 aa  90.1  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.76 
 
 
168 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.76 
 
 
168 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  39.1 
 
 
175 aa  89.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.76 
 
 
168 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  40.87 
 
 
147 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  37.1 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.67 
 
 
176 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
168 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
174 aa  87.4  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  35.45 
 
 
176 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  35.45 
 
 
176 aa  87  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  37.98 
 
 
168 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  42.98 
 
 
157 aa  87  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  38.18 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
139 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15050  acyl-CoA hydrolase  38.98 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809768  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
128 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  41.38 
 
 
170 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 
170 aa  82  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.66 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.66 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  39.66 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  39.66 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.66 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  34.59 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  41.28 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  37.61 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3758  putative acyl-CoA thioester hydrolase  34.62 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  37.61 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  39.83 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>