More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2454 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
131 aa  270  6e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  89.31 
 
 
131 aa  248  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  65.57 
 
 
141 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  65.57 
 
 
141 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  60.8 
 
 
137 aa  168  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  56.92 
 
 
135 aa  164  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 
135 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 
135 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  57.36 
 
 
135 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  55.12 
 
 
129 aa  159  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  51.18 
 
 
136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  55.37 
 
 
143 aa  147  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  53.28 
 
 
149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  52.8 
 
 
143 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  52.8 
 
 
143 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  52.8 
 
 
143 aa  144  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  51.59 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  52.8 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  52.8 
 
 
132 aa  144  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  52.8 
 
 
154 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  52.8 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  52.8 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  52.8 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  52 
 
 
141 aa  143  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 
142 aa  141  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 
141 aa  141  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  52 
 
 
143 aa  140  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
131 aa  139  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  52.46 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  50.79 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  49.6 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
139 aa  117  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 
136 aa  108  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  40.71 
 
 
120 aa  106  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 
131 aa  106  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  40.71 
 
 
120 aa  106  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 
131 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 
165 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 
143 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
133 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  40.87 
 
 
141 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  42.73 
 
 
263 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  38.74 
 
 
260 aa  91.3  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
265 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  37.61 
 
 
119 aa  84.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 
133 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  36.11 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  36.11 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.19 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.61 
 
 
118 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.71 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  32.74 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  36.7 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  28.79 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  40 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  40 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  31.19 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.09 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.09 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  36.13 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  39.09 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.09 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
143 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  30.36 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  31.82 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5863  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>