More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2108 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
132 aa  270  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  65.87 
 
 
129 aa  188  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  62.02 
 
 
132 aa  179  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  65.08 
 
 
127 aa  172  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  62.99 
 
 
136 aa  170  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  64.52 
 
 
131 aa  170  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
143 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
143 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 
145 aa  161  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
143 aa  161  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  60 
 
 
143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  57.48 
 
 
142 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  57.81 
 
 
143 aa  159  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  57.6 
 
 
141 aa  158  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  59.2 
 
 
143 aa  158  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  59.2 
 
 
142 aa  157  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 
154 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 
154 aa  156  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 
154 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  55.91 
 
 
141 aa  156  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 
154 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 
149 aa  156  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  57.6 
 
 
135 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  57.6 
 
 
135 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  57.6 
 
 
135 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  55.3 
 
 
141 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  55.3 
 
 
141 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  56.8 
 
 
135 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  56.8 
 
 
137 aa  150  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  53.6 
 
 
131 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  51.59 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  55.17 
 
 
139 aa  138  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  46.55 
 
 
143 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 
141 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  42.48 
 
 
120 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  42.48 
 
 
120 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 
133 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 
136 aa  106  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  43.22 
 
 
176 aa  97.4  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
263 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 
119 aa  94.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
120 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 
265 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 
260 aa  86.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  35.9 
 
 
175 aa  84  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  35.71 
 
 
176 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  36.13 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  35.71 
 
 
176 aa  82  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 
188 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  37.29 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.94 
 
 
118 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  38.32 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.28 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  36.45 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  36.45 
 
 
178 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  34.96 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
167 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
167 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  34.58 
 
 
166 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
168 aa  77  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  34.58 
 
 
166 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  34.58 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 
161 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  35.58 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  36.45 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  34.58 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.64 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.29 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.29 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  34.58 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  35.29 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>