More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0724 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  100 
 
 
118 aa  243  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0621  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  74.58 
 
 
135 aa  191  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0826  thioesterase superfamily protein  75 
 
 
121 aa  185  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  69.49 
 
 
130 aa  184  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0941  thioesterase superfamily protein  70.69 
 
 
119 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  73.28 
 
 
118 aa  177  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1626  thioesterase superfamily protein  69.83 
 
 
119 aa  173  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.928408  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
136 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  43.86 
 
 
132 aa  84  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  42.24 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  41.23 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  41.59 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  39.62 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  38.94 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.29 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  34.55 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  34.55 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  38.94 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  38.94 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.51 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  33.63 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  33.63 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  35.71 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  38.39 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  40 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0206  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.627251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  35.71 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  40.35 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
167 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
167 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  40.35 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  36.61 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0050  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
180 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  40.18 
 
 
175 aa  67  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.82 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  33.64 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  33.93 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  31.86 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1723  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  36.54 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  37.14 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  36.54 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  36.54 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  37.14 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  34.23 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  34.23 
 
 
171 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.23 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  34.23 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>