More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2813 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  70.63 
 
 		 129 aa  193  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  66.93 
 
 		 131 aa  177  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  65.08 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  63.2 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  62.4 
 
 		 135 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  62.4 
 
 		 135 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  62.4 
 
 		 135 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  63.71 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  61.6 
 
 		 135 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  63.71 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  63.71 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  63.71 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  63.71 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  62.3 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  62.3 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  62.1 
 
 		 154 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  62.1 
 
 		 154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  62.1 
 
 		 154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  62.1 
 
 		 154 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  62.9 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  62.1 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  63.64 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  59.68 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  60.8 
 
 		 137 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  61.98 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  59.68 
 
 		 142 aa  155  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  58.87 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  60.48 
 
 		 132 aa  154  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  56.35 
 
 		 136 aa  149  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  52.38 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  50.79 
 
 		 131 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  48.7 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  48.7 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  48.31 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  46.96 
 
 		 136 aa  115  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  39.68 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 		 176 aa  100  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 263 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 		 175 aa  95.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  38.46 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 		 168 aa  94  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  40.37 
 
 		 260 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.32 
 
 		 171 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  41.32 
 
 		 171 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  41.32 
 
 		 171 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.32 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.32 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.32 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.32 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.32 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.74 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.5 
 
 		 168 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  38.53 
 
 		 265 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 120 aa  87.4  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  34.96 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  33.86 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  33.87 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.68 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  40.68 
 
 		 170 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.68 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.68 
 
 		 170 aa  80.1  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  40.68 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  40.68 
 
 		 170 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  33.61 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.59 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.83 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  39.83 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  39.83 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  33.06 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  41 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  39.83 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  35.19 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>