More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39520 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  100 
 
 
143 aa  294  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  76.26 
 
 
141 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  76.26 
 
 
141 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  76.64 
 
 
137 aa  222  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  75.94 
 
 
135 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  75.94 
 
 
135 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  75.94 
 
 
135 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  75.19 
 
 
135 aa  216  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  65.08 
 
 
141 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  67.48 
 
 
141 aa  178  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  65.35 
 
 
142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  65.08 
 
 
154 aa  176  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  68.6 
 
 
129 aa  176  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  67.77 
 
 
143 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  63.91 
 
 
154 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  63.91 
 
 
154 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  67.77 
 
 
143 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  67.77 
 
 
143 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  63.78 
 
 
145 aa  176  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  67.77 
 
 
143 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  63.91 
 
 
154 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  61.07 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 
143 aa  175  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  60.28 
 
 
149 aa  174  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  63.2 
 
 
127 aa  169  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  61.42 
 
 
141 aa  167  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  60.8 
 
 
136 aa  163  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  63.71 
 
 
131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  57.81 
 
 
132 aa  159  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  57.02 
 
 
131 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  60.31 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  55.37 
 
 
131 aa  147  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  51.69 
 
 
139 aa  125  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  46.62 
 
 
133 aa  120  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  50.89 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  50.89 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  46.22 
 
 
131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 
136 aa  110  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  44.92 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  42.19 
 
 
165 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 
141 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
143 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 
260 aa  100  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  48.65 
 
 
263 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
176 aa  97.1  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 
265 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.66 
 
 
176 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  36.67 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  36.67 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
175 aa  88.2  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 
164 aa  87  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
167 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  40.83 
 
 
178 aa  85.1  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 
168 aa  84  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.4 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  37.4 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  37.4 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.4 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.4 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.4 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.64 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.64 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.64 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  38.66 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  40.35 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  34.35 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0825  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
118 aa  73.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216993  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0724  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.218128  normal  0.79539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  29.41 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  34.96 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  30.53 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  29.92 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  38.02 
 
 
170 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
167 aa  70.1  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  38.02 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1900  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>