More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0209 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
133 aa  273  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  58.41 
 
 
263 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
260 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  54.1 
 
 
176 aa  134  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1772  thioesterase superfamily protein  54.1 
 
 
139 aa  134  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.917959  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
143 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  47.58 
 
 
143 aa  130  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0605  thioesterase superfamily protein  52.5 
 
 
265 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 
149 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  50.85 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 
154 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  48.74 
 
 
142 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3092  thioesterase superfamily protein  50.42 
 
 
131 aa  125  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.440114 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  50.88 
 
 
136 aa  124  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  45.16 
 
 
141 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2938  thioesterase superfamily protein  48.74 
 
 
131 aa  124  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00161  hitchhiker  0.0050577 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 
145 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1546  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 
141 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.125376  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39520  Acyl-CoA thioester hydrolase-like protein  46.62 
 
 
143 aa  120  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06210  hypothetical protein  43.31 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.391059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  50.44 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1378  hypothetical protein  45.38 
 
 
141 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16010  hypothetical protein  45.38 
 
 
141 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0116317  normal  0.606256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1071  thioesterase superfamily protein  45 
 
 
135 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.54518  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4153  thioesterase superfamily protein  45 
 
 
135 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.351728  normal  0.558085 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3231  hypothetical protein  49.12 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127576  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1466  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119428  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3417  major facilitator transporter  49.12 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.264659  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4255  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  43.22 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0966  thioesterase superfamily protein  48.65 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 
164 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1023  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 
137 aa  110  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0908127  normal  0.533657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6483  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.474329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  44.17 
 
 
172 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2108  thioesterase superfamily protein  40.32 
 
 
132 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2549  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
131 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 
159 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2454  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
131 aa  104  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1494  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 
120 aa  103  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0134536  hitchhiker  0.0000450993 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 
167 aa  101  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 
182 aa  100  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0391  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 
119 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1349  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 
133 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120943  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 
171 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  42.06 
 
 
160 aa  98.2  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  41.03 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3244  thioesterase superfamily protein  43.22 
 
 
168 aa  97.1  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0288964  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3496  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  33.61 
 
 
180 aa  96.3  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  40.5 
 
 
173 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  42.11 
 
 
170 aa  96.3  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0827  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
148 aa  94.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2687  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 
167 aa  94.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.793889  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 
169 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.64 
 
 
168 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  43.64 
 
 
168 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 
174 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.73 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  42.73 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  42.73 
 
 
171 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.73 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.73 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.73 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
161 aa  92  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  36.22 
 
 
185 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 
155 aa  92  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 
178 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.73 
 
 
168 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  41.82 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
171 aa  90.1  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  40.65 
 
 
168 aa  90.1  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
185 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
188 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  41.82 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  44.64 
 
 
170 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
168 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 
162 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1269  thioesterase superfamily protein  44.17 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1622  thioesterase superfamily protein  38.64 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
170 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  35.29 
 
 
169 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  33.61 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  35.2 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>