More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2480 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  100 
 
 		 185 aa  383  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  57.22 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  58.24 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  52.22 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  53.65 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  53.16 
 
 		 180 aa  175  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  49.7 
 
 		 168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  47.4 
 
 		 163 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  48.05 
 
 		 168 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  47.77 
 
 		 164 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  52.35 
 
 		 169 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  47.77 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  47.77 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  48.73 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  47.77 
 
 		 167 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  47.77 
 
 		 167 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  46.45 
 
 		 161 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  43.95 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  46.1 
 
 		 167 aa  147  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  46.88 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  47.4 
 
 		 169 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  44.23 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  44.81 
 
 		 160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  44.87 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  47.68 
 
 		 168 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  49.65 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  47.47 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  44.59 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  43.75 
 
 		 166 aa  140  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  45.51 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  54.1 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  43.12 
 
 		 166 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  51.47 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  47.26 
 
 		 153 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  52.24 
 
 		 146 aa  138  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 		 162 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  44.16 
 
 		 160 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  46.1 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  44.81 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  46.1 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  51.18 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  50.79 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  55.2 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  50.85 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  44.23 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  44.23 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  44.74 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 		 167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 		 248 aa  110  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  37.97 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  40.74 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.55 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  41.3 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  43.85 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  45.6 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  42.5 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  42.5 
 
 		 163 aa  103  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  39.72 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  43.18 
 
 		 170 aa  101  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  43.2 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  32.72 
 
 		 171 aa  99  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 		 159 aa  98.2  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.62 
 
 		 159 aa  97.8  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0351  thioesterase superfamily protein  41.53 
 
 		 147 aa  97.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 159 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 159 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 159 aa  97.4  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  40.31 
 
 		 161 aa  97.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  36.81 
 
 		 168 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 168 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  38.16 
 
 		 168 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0610  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 		 170 aa  95.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  40.31 
 
 		 158 aa  95.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0969  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 		 170 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0965  thioesterase superfamily protein  42.61 
 
 		 170 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.06 
 
 		 159 aa  94.4  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4202  thioesterase superfamily protein  41.74 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0276  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 		 176 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.800704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.9 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.64 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  41.18 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>