More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1146 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  100 
 
 
140 aa  285  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  86.36 
 
 
146 aa  237  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  88.1 
 
 
169 aa  234  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  84.43 
 
 
131 aa  224  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  66.4 
 
 
139 aa  184  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  61.15 
 
 
154 aa  183  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  64 
 
 
140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  62.99 
 
 
132 aa  178  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  62.99 
 
 
132 aa  178  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  62.99 
 
 
132 aa  178  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  62.99 
 
 
132 aa  178  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  62.99 
 
 
132 aa  178  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  64 
 
 
130 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  62.99 
 
 
132 aa  178  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  64 
 
 
130 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  64 
 
 
130 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  62.99 
 
 
132 aa  178  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  64 
 
 
130 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  62.99 
 
 
132 aa  178  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  64 
 
 
130 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  62.2 
 
 
132 aa  176  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  62.7 
 
 
132 aa  175  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  60.98 
 
 
140 aa  173  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  60.16 
 
 
135 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  61.98 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  61.98 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  61.98 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  59.35 
 
 
142 aa  167  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  58.91 
 
 
141 aa  158  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  57.48 
 
 
126 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  57.48 
 
 
126 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 
139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  54.76 
 
 
139 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  55.2 
 
 
134 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  51.54 
 
 
139 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  51.88 
 
 
136 aa  148  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  54.76 
 
 
139 aa  146  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  53.66 
 
 
151 aa  144  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  48.46 
 
 
141 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 
129 aa  139  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  47.73 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  43.48 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  55 
 
 
142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  48.03 
 
 
132 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  48.41 
 
 
136 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  48 
 
 
149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  49.21 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  48.76 
 
 
143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3758  putative acyl-CoA thioester hydrolase  43.28 
 
 
134 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  48.41 
 
 
154 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  48.76 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 
130 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  47.9 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  46.72 
 
 
129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  49.19 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  46.83 
 
 
139 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  45.9 
 
 
130 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  43.51 
 
 
146 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  43.94 
 
 
158 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  44.09 
 
 
129 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  44.09 
 
 
129 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
129 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 
128 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  45.31 
 
 
143 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  45.86 
 
 
143 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 
136 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  45.04 
 
 
157 aa  120  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0368  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
145 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0353  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0922  thioesterase family protein  44.17 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000350062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0993  thioesterase family protein  44.17 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  44.27 
 
 
133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  47.66 
 
 
132 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0899  thioesterase family protein  43.33 
 
 
137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000117168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3463  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 
155 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.211669  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  41.09 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1642  acyl-CoA thioester hydrolase YciA  41.46 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0172566  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0584  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0157  thioesterase superfamily protein  45.6 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2103  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174742  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2715  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2742  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603577  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3630  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 
134 aa  114  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6042  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  40.94 
 
 
131 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0571  thioesterase domain-containing protein  40.15 
 
 
228 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2146  thioesterase family protein  43.33 
 
 
137 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1269  conserved hypothetical protein, putative acyl-coA thioester hydrolase  45.83 
 
 
134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00039467  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2633  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0671  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 
131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2767  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  41.8 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  41.8 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  41.8 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1278  acyl-CoA hydrolase  41.67 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>