More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0438 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  100 
 
 
143 aa  287  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  83.9 
 
 
155 aa  201  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  61.97 
 
 
146 aa  176  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  70.25 
 
 
150 aa  173  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  67.72 
 
 
143 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  67.48 
 
 
158 aa  168  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  67.5 
 
 
158 aa  168  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  65.89 
 
 
157 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  61.54 
 
 
141 aa  167  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3463  thioesterase superfamily protein  66.94 
 
 
155 aa  160  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.211669  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0349  thioesterase superfamily protein  57.75 
 
 
151 aa  157  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  64.71 
 
 
270 aa  156  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  59.84 
 
 
131 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0392  thioesterase superfamily protein  56.12 
 
 
135 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12158 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2416  thioesterase family protein  55.32 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2336  thioesterase domain-containing protein  55.32 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2742  thioesterase family protein  55.32 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  55.32 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0866  thioesterase superfamily protein  55.32 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  55.32 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  55.32 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0671  thioesterase superfamily protein  60.33 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0571  thioesterase domain-containing protein  55.32 
 
 
228 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6042  thioesterase superfamily protein  62.61 
 
 
136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  60.87 
 
 
133 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2742  thioesterase superfamily protein  62.61 
 
 
136 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603577  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2103  thioesterase superfamily protein  62.61 
 
 
136 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174742  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2715  thioesterase superfamily protein  62.61 
 
 
136 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  61.34 
 
 
139 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0584  thioesterase superfamily protein  63.48 
 
 
166 aa  141  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2767  thioesterase superfamily protein  62.61 
 
 
136 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2633  thioesterase superfamily protein  62.61 
 
 
131 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  62.39 
 
 
139 aa  140  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0368  thioesterase superfamily protein  55.97 
 
 
145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0353  thioesterase superfamily protein  60.68 
 
 
145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  52.5 
 
 
139 aa  137  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  57.76 
 
 
155 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  48.8 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  46.51 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  48.78 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  46.28 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  46.77 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  46.56 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  51.67 
 
 
143 aa  123  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  41.96 
 
 
154 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  43.8 
 
 
149 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  43.8 
 
 
149 aa  122  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  46.22 
 
 
149 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  43.8 
 
 
149 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  46.34 
 
 
130 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  45.86 
 
 
140 aa  121  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  46.34 
 
 
130 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  48.33 
 
 
131 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  46.34 
 
 
130 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  46.34 
 
 
130 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  47.06 
 
 
132 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
132 aa  120  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  47.06 
 
 
132 aa  120  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  47.06 
 
 
132 aa  120  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  47.06 
 
 
132 aa  120  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  47.06 
 
 
132 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  47.06 
 
 
132 aa  120  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  47.06 
 
 
132 aa  120  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  46.67 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  46.72 
 
 
169 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  47.24 
 
 
139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  46.22 
 
 
132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  46.22 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  43.9 
 
 
142 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  47.24 
 
 
139 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3058  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
126 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  46.22 
 
 
143 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  48.72 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  48.72 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  48.72 
 
 
129 aa  114  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 
139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  42.86 
 
 
130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  52.46 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  44.09 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  48.7 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  44.09 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  45.08 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 
136 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1875  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 
139 aa  110  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  45.6 
 
 
130 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  41.46 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  41.46 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0993  thioesterase family protein  42.24 
 
 
137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0922  thioesterase family protein  42.24 
 
 
137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000350062  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1269  conserved hypothetical protein, putative acyl-coA thioester hydrolase  49.11 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00039467  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0899  thioesterase family protein  40.52 
 
 
137 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000117168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5380  thioesterase superfamily protein  43.85 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  0.245761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5489  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.64 
 
 
133 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>