More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6255 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  100 
 
 		 130 aa  269  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  65.62 
 
 		 128 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  65.62 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  65.62 
 
 		 128 aa  176  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  63.93 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  63.93 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  59.38 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  61.48 
 
 		 139 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  60.66 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  59.52 
 
 		 139 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  59.2 
 
 		 134 aa  157  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  59.2 
 
 		 139 aa  156  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  59.2 
 
 		 139 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  62.39 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  57.94 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  55.04 
 
 		 143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  58.33 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  52.03 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  49.61 
 
 		 169 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  55.28 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  49.21 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0157  thioesterase superfamily protein  54.1 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  50.39 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  49.21 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  50.42 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  51.18 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  48.74 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  48.74 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  51.59 
 
 		 139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  49.6 
 
 		 136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  48.76 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  51.64 
 
 		 140 aa  129  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  50.82 
 
 		 140 aa  130  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  50.82 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1004  thioesterase superfamily protein  48.36 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.648637  normal  0.368957 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  50.82 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  50.82 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  50.82 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  50.82 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  50.82 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3758  putative acyl-CoA thioester hydrolase  48.82 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  49.6 
 
 		 132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  47.58 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  47.58 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  47.58 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  48.8 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  48.8 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  48.8 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  48.8 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  48.8 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  48.8 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  48.8 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  48.33 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  46.72 
 
 		 142 aa  120  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  44.72 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  46.88 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  51.33 
 
 		 132 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  45.16 
 
 		 141 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3269  thioesterase superfamily protein  48.89 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  48.31 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1489  thioesterase superfamily protein  48.72 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.596462 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  42.86 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  44.54 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  46.15 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15050  acyl-CoA hydrolase  43.55 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5489  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  45.38 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5043  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6530  thioesterase superfamily protein  53.15 
 
 		 147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.018702  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5617  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176202  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  43.51 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6721  thioesterase superfamily protein  52.73 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0422424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0349  thioesterase superfamily protein  45.53 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5380  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 132 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  0.245761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5331  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.941741  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  48.21 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0143  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5239  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327766  normal  0.0636832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2205  thioesterase superfamily protein  47.93 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6156  hypothetical protein  41.22 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.015412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70930  hypothetical protein  41.22 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.193161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1929  thioesterase superfamily protein  47.93 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3058  thioesterase superfamily protein  46.72 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  48.21 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1820  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.45574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3463  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.211669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48610  Thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0082  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 133 aa  103  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  44.92 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  44.26 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>