More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0082 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0082  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 133 aa  270  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70930  hypothetical protein  91.73 
 
 		 134 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.193161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6156  hypothetical protein  91.73 
 
 		 134 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.015412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5331  thioesterase superfamily protein  91.67 
 
 		 132 aa  247  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.941741  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0143  thioesterase superfamily protein  91.67 
 
 		 132 aa  247  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5617  thioesterase superfamily protein  91.67 
 
 		 162 aa  247  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176202  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5239  thioesterase superfamily protein  91.67 
 
 		 132 aa  247  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327766  normal  0.0636832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5380  thioesterase superfamily protein  90.91 
 
 		 132 aa  245  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  0.245761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5043  thioesterase superfamily protein  88.72 
 
 		 133 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5489  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  87.97 
 
 		 133 aa  241  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48610  Thioesterase superfamily protein  84.85 
 
 		 132 aa  233  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3758  putative acyl-CoA thioester hydrolase  55.12 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3630  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249001  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  49.21 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3269  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  51.33 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  46.51 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  47.29 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  47.66 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  46.51 
 
 		 142 aa  123  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  45.04 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  45.04 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  45.04 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  50.39 
 
 		 136 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  44.19 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  44.19 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  44.19 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  44.19 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  47.5 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  43.9 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  44.35 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  47.93 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  44.44 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  48.44 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  44 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  44 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  44 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  44 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  44 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  44 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  44 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  44 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  46.4 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  43.2 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  47.66 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 		 130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15050  acyl-CoA hydrolase  44.17 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  38.35 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  45 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  48.31 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  48.74 
 
 		 130 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  44.17 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  43.08 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  46.46 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1004  thioesterase superfamily protein  47.5 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.648637  normal  0.368957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  43.9 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  44.92 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 		 141 aa  105  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  40.94 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 		 157 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 		 143 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  40.83 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  40.83 
 
 		 129 aa  103  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  42.86 
 
 		 130 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  40.65 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0157  thioesterase superfamily protein  45.67 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  39.06 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1489  thioesterase superfamily protein  46.49 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.596462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  40.98 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0671  thioesterase superfamily protein  40.98 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  42.86 
 
 		 143 aa  100  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0392  thioesterase superfamily protein  41.8 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2416  thioesterase family protein  42.62 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2742  thioesterase family protein  42.62 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2336  thioesterase domain-containing protein  42.62 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  42.62 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0866  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  42.62 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  42.62 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0571  thioesterase domain-containing protein  42.62 
 
 		 228 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0584  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  38.3 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 		 157 aa  97.4  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>