More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_15050 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_15050  acyl-CoA hydrolase  100 
 
 
152 aa  303  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809768  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  58.82 
 
 
136 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  59.5 
 
 
132 aa  148  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  55.65 
 
 
130 aa  141  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  56.1 
 
 
136 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  53.12 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  55.26 
 
 
143 aa  130  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1489  thioesterase superfamily protein  55 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.596462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  60 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
157 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0157  thioesterase superfamily protein  56.56 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0368  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
145 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0364  thioesterase superfamily protein  58.68 
 
 
148 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1820  thioesterase superfamily protein  57.26 
 
 
139 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.45574  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0353  thioesterase superfamily protein  48.39 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0392  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
135 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12158 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  50.41 
 
 
132 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  50.41 
 
 
132 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  50.41 
 
 
132 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2336  thioesterase domain-containing protein  50.41 
 
 
132 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0866  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
132 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2742  thioesterase family protein  50.41 
 
 
132 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2416  thioesterase family protein  50.41 
 
 
132 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48610  Thioesterase superfamily protein  48.33 
 
 
132 aa  120  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6530  thioesterase superfamily protein  53.08 
 
 
147 aa  121  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.018702  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  53.04 
 
 
150 aa  120  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0571  thioesterase domain-containing protein  50.41 
 
 
228 aa  120  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  49.12 
 
 
139 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  49.12 
 
 
139 aa  120  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  47.29 
 
 
143 aa  120  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1929  thioesterase superfamily protein  57.02 
 
 
139 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 
141 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2205  thioesterase superfamily protein  56.52 
 
 
139 aa  120  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  46.67 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  46.67 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0671  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  50.88 
 
 
129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1004  thioesterase superfamily protein  43.65 
 
 
136 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.648637  normal  0.368957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  49.59 
 
 
131 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  48.67 
 
 
154 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  48.39 
 
 
139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5380  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  0.245761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5617  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176202  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5331  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 
132 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.941741  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5239  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 
132 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327766  normal  0.0636832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0143  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 
132 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  49.56 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6721  thioesterase superfamily protein  56.52 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0422424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  46.77 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  44.44 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  47.58 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  45.97 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3758  putative acyl-CoA thioester hydrolase  44.44 
 
 
134 aa  115  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  42.74 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 
139 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3630  thioesterase superfamily protein  44.74 
 
 
134 aa  113  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  46.49 
 
 
134 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  47.37 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5489  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  44.17 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0082  thioesterase superfamily protein  44.17 
 
 
133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  47.37 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5043  thioesterase superfamily protein  44.17 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  45.61 
 
 
129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 
141 aa  110  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6156  hypothetical protein  43.33 
 
 
134 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.015412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70930  hypothetical protein  43.33 
 
 
134 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.193161 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  43.55 
 
 
130 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 
139 aa  110  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  40.62 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  40.62 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  40.62 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  42.74 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  42.74 
 
 
132 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
132 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  42.74 
 
 
132 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  42.74 
 
 
132 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  42.74 
 
 
132 aa  108  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
139 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  42.74 
 
 
132 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  42.74 
 
 
132 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  42.74 
 
 
132 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  42.74 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2742  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603577  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  43.09 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2103  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174742  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2715  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6042  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
136 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2767  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 
136 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  43.09 
 
 
139 aa  107  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2633  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 
131 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  38.93 
 
 
157 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0584  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
166 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>