More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0353 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0353  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 145 aa  296  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0368  thioesterase superfamily protein  97.24 
 
 		 145 aa  287  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  86.23 
 
 		 139 aa  244  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  80.31 
 
 		 157 aa  205  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  81.1 
 
 		 133 aa  205  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2767  thioesterase superfamily protein  77.69 
 
 		 136 aa  200  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2103  thioesterase superfamily protein  77.69 
 
 		 136 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174742  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2742  thioesterase superfamily protein  77.69 
 
 		 136 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2715  thioesterase superfamily protein  77.69 
 
 		 136 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2633  thioesterase superfamily protein  77.69 
 
 		 131 aa  200  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0392  thioesterase superfamily protein  76.52 
 
 		 135 aa  199  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12158 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6042  thioesterase superfamily protein  73.57 
 
 		 136 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2416  thioesterase family protein  78.86 
 
 		 132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  78.86 
 
 		 132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0866  thioesterase superfamily protein  78.86 
 
 		 132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2742  thioesterase family protein  78.86 
 
 		 132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  78.86 
 
 		 132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  78.86 
 
 		 132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2336  thioesterase domain-containing protein  78.86 
 
 		 132 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0571  thioesterase domain-containing protein  78.23 
 
 		 228 aa  196  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0584  thioesterase superfamily protein  71.83 
 
 		 166 aa  196  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  74.24 
 
 		 131 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0671  thioesterase superfamily protein  74.24 
 
 		 131 aa  191  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  73.02 
 
 		 155 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  63.31 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3463  thioesterase superfamily protein  58.2 
 
 		 155 aa  153  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.211669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  55.97 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  63.41 
 
 		 270 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  54.68 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  57.72 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0349  thioesterase superfamily protein  60.63 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  53.91 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  62.07 
 
 		 155 aa  144  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  60.68 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  52.76 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  52.8 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15050  acyl-CoA hydrolase  48.39 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  45.65 
 
 		 139 aa  123  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  48.31 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  49.57 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1269  conserved hypothetical protein, putative acyl-coA thioester hydrolase  51.79 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00039467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  44.88 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  44.88 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  44.88 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1489  thioesterase superfamily protein  48.33 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.596462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  48.72 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  47.86 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  43.41 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  44.78 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  46.15 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 136 aa  119  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  47.86 
 
 		 134 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  46.15 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  48.31 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0993  thioesterase family protein  46.61 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0922  thioesterase family protein  46.61 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000350062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  47.86 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0899  thioesterase family protein  44.92 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000117168  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  45.67 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  43.08 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  47.01 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  46.15 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1278  acyl-CoA hydrolase  49.15 
 
 		 136 aa  117  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  46.88 
 
 		 145 aa  116  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1642  acyl-CoA thioester hydrolase YciA  46.61 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0172566  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  48.76 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  45.3 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  47.01 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  47.01 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  47.01 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  47.01 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  45.3 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  45.3 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  48.31 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  45.3 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  45.3 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  45.3 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  45.3 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  45.3 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2709  thioesterase superfamily protein  43.18 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  45.3 
 
 		 132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  46.15 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3058  thioesterase superfamily protein  48.76 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  44.44 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  45.3 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  45.3 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2146  thioesterase family protein  44.92 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  43.8 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  46.55 
 
 		 130 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 		 128 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  45.69 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>