More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0822 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 141 aa  291  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  74.44 
 
 		 150 aa  213  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  81.15 
 
 		 158 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  75.2 
 
 		 146 aa  208  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  72.87 
 
 		 157 aa  207  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  72.87 
 
 		 143 aa  206  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3463  thioesterase superfamily protein  76.61 
 
 		 155 aa  204  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.211669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  73.11 
 
 		 158 aa  186  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  69.23 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  61.54 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0353  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 		 145 aa  154  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  54.03 
 
 		 133 aa  153  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  55.83 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0368  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  58.47 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0866  thioesterase superfamily protein  58.47 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2336  thioesterase domain-containing protein  58.47 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  58.47 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2416  thioesterase family protein  58.47 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2742  thioesterase family protein  58.47 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  58.47 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0392  thioesterase superfamily protein  57.63 
 
 		 135 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.12158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  56.1 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0571  thioesterase domain-containing protein  58.47 
 
 		 228 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0584  thioesterase superfamily protein  57.89 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0671  thioesterase superfamily protein  57.02 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  57.02 
 
 		 131 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2767  thioesterase superfamily protein  58.04 
 
 		 136 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2633  thioesterase superfamily protein  58.04 
 
 		 131 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  50.39 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2103  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174742  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2742  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2715  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6042  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0650  thioesterase superfamily protein  55.26 
 
 		 270 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0349  thioesterase superfamily protein  55.74 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  54.84 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 		 134 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 		 139 aa  133  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  49.58 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  53.91 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  48.74 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  47.93 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  47.11 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 		 139 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  44.29 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 		 136 aa  130  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  52.85 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  47.9 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  47.93 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  48.03 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  47.11 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  44 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  44 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  47.01 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  47.01 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  44 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  45.38 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  48.72 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  44.54 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  44.63 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  47.46 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15050  acyl-CoA hydrolase  44.03 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 130 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  44.07 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2709  thioesterase superfamily protein  51.33 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  42.86 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0775  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1489  thioesterase superfamily protein  50.88 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.596462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1004  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.648637  normal  0.368957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0993  thioesterase family protein  43.7 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  45.97 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0922  thioesterase family protein  43.7 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000350062  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  45.97 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0899  thioesterase family protein  42.86 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000117168  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>