More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2709 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2709  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
130 aa  260  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  53.6 
 
 
136 aa  131  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  53.39 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  51.16 
 
 
139 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  50.79 
 
 
139 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  50.81 
 
 
139 aa  120  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  51.64 
 
 
134 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  47.66 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  47.66 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0866  thioesterase superfamily protein  47.66 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  47.66 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2336  thioesterase domain-containing protein  47.66 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2416  thioesterase family protein  47.66 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2742  thioesterase family protein  47.66 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  51.33 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  46.49 
 
 
126 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  46.49 
 
 
126 aa  118  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0571  thioesterase domain-containing protein  48.76 
 
 
228 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0392  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 
135 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 
133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  53.1 
 
 
142 aa  116  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  45.6 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  48.28 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3630  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249001  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  49.19 
 
 
139 aa  114  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
149 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  45.9 
 
 
158 aa  114  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  46.61 
 
 
155 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  49.57 
 
 
143 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  46.56 
 
 
157 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  44.92 
 
 
139 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  49.14 
 
 
131 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0368  thioesterase superfamily protein  44 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0353  thioesterase superfamily protein  43.18 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  41.54 
 
 
136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0671  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 
131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  45.76 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  45.69 
 
 
136 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  41.98 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6042  thioesterase superfamily protein  44.27 
 
 
136 aa  110  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 
139 aa  110  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1004  thioesterase superfamily protein  48.09 
 
 
136 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.648637  normal  0.368957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  43.61 
 
 
150 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2742  thioesterase superfamily protein  44.27 
 
 
136 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603577  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2103  thioesterase superfamily protein  44.27 
 
 
136 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174742  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2715  thioesterase superfamily protein  44.27 
 
 
136 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  47.46 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  42.64 
 
 
132 aa  110  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  42.64 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  42.64 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  42.64 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  42.64 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  42.64 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  42.64 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  42.64 
 
 
132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2633  thioesterase superfamily protein  44.27 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2767  thioesterase superfamily protein  44.27 
 
 
136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  43.22 
 
 
140 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  44.8 
 
 
128 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  42.37 
 
 
135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  44.25 
 
 
145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 
154 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  46.22 
 
 
129 aa  107  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 
150 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  45.38 
 
 
130 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  43.22 
 
 
154 aa  107  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  45.38 
 
 
130 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  45.38 
 
 
130 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  45.38 
 
 
130 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 
157 aa  106  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0584  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 
166 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  43.22 
 
 
142 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  48.67 
 
 
143 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  41.88 
 
 
146 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15050  acyl-CoA hydrolase  45.16 
 
 
152 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809768  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  44.63 
 
 
143 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  45.6 
 
 
128 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  44.92 
 
 
158 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  43.59 
 
 
130 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1489  thioesterase superfamily protein  48.72 
 
 
142 aa  103  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.596462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  43.9 
 
 
155 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  41.53 
 
 
149 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  41.53 
 
 
149 aa  103  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  41.53 
 
 
149 aa  103  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0349  thioesterase superfamily protein  48.7 
 
 
151 aa  103  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  43.97 
 
 
143 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0157  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
138 aa  103  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0364  thioesterase superfamily protein  44.35 
 
 
148 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3058  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 
126 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1929  thioesterase superfamily protein  45.52 
 
 
139 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2205  thioesterase superfamily protein  45.52 
 
 
139 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1820  thioesterase superfamily protein  46.27 
 
 
139 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.45574  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 
141 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
129 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>