More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1592 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  99.23 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  92.91 
 
 		 132 aa  248  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  92.91 
 
 		 132 aa  248  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  92.91 
 
 		 132 aa  248  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  92.91 
 
 		 132 aa  248  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  92.91 
 
 		 132 aa  248  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  92.91 
 
 		 132 aa  248  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  92.91 
 
 		 132 aa  248  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  92.91 
 
 		 132 aa  248  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  92.13 
 
 		 132 aa  246  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  92.86 
 
 		 132 aa  245  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  85.48 
 
 		 140 aa  226  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  86.18 
 
 		 149 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  86.18 
 
 		 149 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  86.18 
 
 		 149 aa  223  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  84.55 
 
 		 135 aa  223  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  82.54 
 
 		 140 aa  222  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  82.54 
 
 		 139 aa  222  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  81.3 
 
 		 142 aa  213  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  74.59 
 
 		 154 aa  197  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  63.49 
 
 		 146 aa  180  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  64 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  63.71 
 
 		 131 aa  177  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  62.1 
 
 		 169 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  55.2 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  55.2 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  57.6 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  55.81 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  55.04 
 
 		 134 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  58.2 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  55.81 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  53.6 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  55.56 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3758  putative acyl-CoA thioester hydrolase  56.1 
 
 		 134 aa  141  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  54.26 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  56.91 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  51.54 
 
 		 132 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  51.16 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  51.59 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 		 150 aa  137  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  52.07 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  49.61 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  51.59 
 
 		 154 aa  133  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  56.78 
 
 		 132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  48.8 
 
 		 136 aa  130  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  52.89 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  50.82 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4027  thioesterase superfamily protein  49.58 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000934062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5489  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  46.51 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5043  thioesterase superfamily protein  46.51 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1348  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1510  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase, putative  46.09 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1460  putative long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  46.09 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2125  thioesterase superfamily protein  48.78 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0438  acyl-CoA hydrolase-like protein  46.34 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3630  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249001  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0584  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0082  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 		 141 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  47.11 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2205  thioesterase superfamily protein  51.61 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1929  thioesterase superfamily protein  50.79 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  45.97 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  47.97 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  47.2 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6156  hypothetical protein  44.09 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.015412  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  44.54 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70930  hypothetical protein  44.09 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.193161 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  44.54 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1655  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904964  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  48.72 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0993  thioesterase family protein  45 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1820  thioesterase superfamily protein  51.61 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.45574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0922  thioesterase family protein  45 
 
 		 137 aa  117  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000350062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3058  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0364  thioesterase superfamily protein  52.03 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5331  thioesterase superfamily protein  44.09 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.941741  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5239  thioesterase superfamily protein  44.09 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327766  normal  0.0636832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0143  thioesterase superfamily protein  44.09 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0899  thioesterase family protein  44.17 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000117168  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5617  thioesterase superfamily protein  44.09 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176202  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0359  putative acyl-CoA thioester hydrolase  46.61 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.183567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  44.72 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  44.72 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  44.72 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  46.22 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2767  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2715  thioesterase superfamily protein  45.53 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2336  thioesterase domain-containing protein  44.72 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2416  thioesterase family protein  44.72 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2742  thioesterase superfamily protein  45.53 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2742  thioesterase family protein  44.72 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>