More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1366 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1366  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 130 aa  261  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.147408  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0858  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1457  thioesterase superfamily protein  59.06 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.412041  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1282  thioesterase superfamily protein  63.03 
 
 		 136 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.484211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3818  thioesterase superfamily protein  57.98 
 
 		 151 aa  144  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.268375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0157  thioesterase superfamily protein  57.5 
 
 		 138 aa  141  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0030  thioesterase superfamily protein  55.46 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137519  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15050  acyl-CoA hydrolase  55.65 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0809768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2575  thioesterase superfamily protein  55.46 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.588276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2507  thioesterase superfamily protein  55.46 
 
 		 134 aa  140  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.488114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4187  thioesterase superfamily protein  57.26 
 
 		 145 aa  140  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2128  thioesterase superfamily protein  62.61 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2798  thioesterase superfamily protein  54.62 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.585089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2890  hypothetical protein  53.78 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2745  hypothetical protein  53.78 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  55.83 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6530  thioesterase superfamily protein  58.82 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.018702  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0603  thioesterase superfamily protein  56.64 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.926269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2992  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 149 aa  130  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.34104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1489  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 142 aa  130  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.596462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6721  thioesterase superfamily protein  58.77 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0422424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1088  thioesterase superfamily protein  51.64 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2218  Acyl-CoA thioester hydrolase  52.94 
 
 		 143 aa  127  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1305  hypothetical protein  48.36 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000164666  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3494  thioesterase superfamily protein  45.67 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2709  thioesterase superfamily protein  50.42 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0822  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3088  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1820  thioesterase superfamily protein  55.56 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.45574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0390  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  47.54 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1146  acyl-CoA thioester hydrolase (p14 protein)  45.9 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6255  acyl-CoA hydrolase  48.33 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0702037  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3235  thioesterase superfamily protein  52.42 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0601  thioesterase superfamily protein  42.52 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.71789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2182  thioesterase superfamily protein  48.74 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1929  thioesterase superfamily protein  53.66 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.433296  normal  0.844818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  45.9 
 
 		 169 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0580  thioesterase superfamily protein  42.52 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2205  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0451  thioesterase superfamily protein  45.9 
 
 		 133 aa  120  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2296  acyl-CoA thioester hydrolase  45.9 
 
 		 140 aa  120  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0364  thioesterase superfamily protein  54.7 
 
 		 148 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3630  thioesterase superfamily protein  48.74 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249001  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3907  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0682264  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1996  acyl-CoA thioester hydrolase  45.08 
 
 		 135 aa  120  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  46.72 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2465  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003074  putative acyl-coA hydrolase  45.08 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0096  thioesterase superfamily protein  43.31 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0385  thioesterase superfamily protein  49.21 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.125314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5489  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  52.1 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5043  thioesterase superfamily protein  52.1 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.10158 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0824  thioesterase superfamily protein  45.97 
 
 		 139 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2678  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 142 aa  116  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.234171  hitchhiker  0.00125297 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2327  acyl-CoA thioester hydrolase  43.41 
 
 		 149 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.176788  normal  0.862202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2054  acyl-CoA thioester hydrolase  43.41 
 
 		 149 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.678705  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1945  acyl-CoA thioester hydrolase  43.41 
 
 		 149 aa  115  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4080  thioesterase superfamily protein  44.72 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.789165  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01227  predicted hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2395  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0166309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01237  hypothetical protein  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1422  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.126928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1411  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.414324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1879  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231895 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1268  acyl-CoA hydrolase  43.1 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.415542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2374  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0799784  hitchhiker  0.00000127096 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1362  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000133322  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3758  putative acyl-CoA thioester hydrolase  43.44 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1740  acyl-CoA thioester hydrolase  44.26 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000269584  hitchhiker  0.00394303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2709  thioesterase superfamily protein  52.54 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.422433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0477  hypothetical protein  43.85 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1614  thioesterase superfamily protein  44.54 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00678446  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0353  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1220  thioesterase superfamily protein  45.9 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1004  thioesterase superfamily protein  46.22 
 
 		 136 aa  113  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.648637  normal  0.368957 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2286  acyl-CoA thioester hydrolase  43.44 
 
 		 132 aa  113  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4028  thioesterase domain-containing protein  44.17 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.210569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0782  thioesterase superfamily protein  45.16 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000656912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0368  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0686  thioesterase family protein  42.64 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2742  thioesterase family protein  42.64 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0203  thioesterase domain-containing protein  42.64 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2336  thioesterase domain-containing protein  42.64 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.600486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0866  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2416  thioesterase family protein  42.64 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0701  thioesterase family protein  42.64 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1869  acyl-CoA thioester hydrolase  42.06 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.592837  normal  0.869947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6156  hypothetical protein  49.58 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.015412  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1926  acyl-CoA thioester hydrolase  42.74 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1592  acyl-CoA thioester hydrolase  42.06 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.849233 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1863  acyl-CoA thioester hydrolase  42.06 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1410  acyl-CoA thioester hydrolase  42.06 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70930  hypothetical protein  49.58 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.193161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5331  thioesterase superfamily protein  47.9 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.941741  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5239  thioesterase superfamily protein  47.9 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327766  normal  0.0636832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0143  thioesterase superfamily protein  47.9 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0571  thioesterase domain-containing protein  42.64 
 
 		 228 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5380  thioesterase superfamily protein  47.9 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  0.245761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>